RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542667.5

TM7SF3-211, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-211ENST00000542667 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP13.31□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 29
TM7SF3-211ENST00000542667 NR4A3Q92570 626 aa13.31□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 CNPPD1Q9BV87 410 aa13.31□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 PARD6BQ9BYG5 372 aa13.31□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 MS4A12Q9NXJ0 267 aa13.31□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 ERVK-19Q9WJR5 959 aa13.31□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 EML6Q6ZMW3 1958 aa13.31□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 PTPN13Q12923 2485 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 A1L4Q6 167 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 OR10H2O60403 315 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 SEMA3DO95025 777 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 UNC5CO95185 931 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 CPA3P15088 417 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 SOX3P41225 446 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 CCT5P48643 541 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 SSR4P51571 173 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 MAPK12P53778 367 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC18A2Q05940 514 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 IFFO1Q0D2I5 559 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 LCP2Q13094 533 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 C1QL3Q5VWW1 255 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 WDR93Q6P2C0 686 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 C10orf107Q8IVU9 208 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 C9orf40Q8IXQ3 194 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 LGI4Q8N135 537 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 APIPQ96GX9 242 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 ACPTQ9BZG2 426 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 AHSPQ9NZD4 102 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC17A7Q9P2U7 560 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 MYOTQ9UBF9 498 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 GRID1Q9ULK0 1009 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 PPT2Q9UMR5 302 aa13.3□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 A0A0G2JMM0 328 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 A0A1W2PPB8 328 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 A0A1W2PRS3 328 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 KIR3DP1A8MWS1 328 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 NPIPA5E9PKD4 350 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 LRRTM2O43300 516 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 NME2P1O60361 137 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 ULK1O75385 1050 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 MLYCDO95822 493 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 KRT6AP02538 564 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 CLPSP04118 112 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 KRT6BP04259 564 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 NUDT17P0C025 328 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 CT62P0C5K7 136 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 COX7A2P14406 83 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 NME2P22392 152 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 SSTR4P31391 388 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 KRT6CP48668 564 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 ALDH9A1P49189 494 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 ARFIP1P53367 373 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 RAE1P78406 368 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 HSF1Q00613 529 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 PLIN5Q00G26 463 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 DUSP2Q05923 314 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 ASPHQ12797 758 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 CCDC153Q494R4 210 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 GFRALQ6UXV0 394 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 TRABD2AQ86V40 505 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 SULF2Q8IWU5 870 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 ARMC10Q8N2F6 343 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 MYRIPQ8NFW9 859 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 CHTF18Q8WVB6 975 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 ASB15Q8WXK1 588 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 RIT1Q92963 219 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 TM4SF18Q96CE8 201 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 FRMD6Q96NE9 622 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 RASL10BQ96S79 203 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 MECRQ9BV79 373 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 EBPLQ9BY08 206 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 WDR41Q9HAD4 459 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 BRF2Q9HAW0 419 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 OXSMQ9NWU1 459 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 VPS29Q9UBQ0 182 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 SEC14L3Q9UDX4 400 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 NPIPA1Q9UND3 350 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 ERVK-11Q9UQG0 969 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa13.29□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa13.28□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 PINLYPA6NC86 204 aa13.28□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 ESRRBO95718 433 aa13.28□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 CRYABP02511 175 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 IGKV3-11P04433 115 aa13.28□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 PIK3R1P27986 724 aa13.28□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 FEN1P39748 380 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
TM7SF3-211ENST00000542667 MEOX1P50221 254 aa13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.2 ms