RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, humanhuman

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1-208ENST00000540501 PDPK1O15530 556 aa24.11■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 FGF17O60258 216 aa24.11■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 SLC35E2P0CK97 266 aa24.11■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 C8orf89P0DMQ9 161 aa24.11■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 PLIN5Q00G26 463 aa24.11■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 MMP21Q8N119 569 aa24.11■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 OR7A2PQ8NGA2 310 aa24.11■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 GATA6Q92908 595 aa24.11■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 CCDC167Q9P0B6 97 aa24.11■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 CFLARO15519 480 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 DYRK3O43781 588 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 SLITRK5O94991 958 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 PGRP06401 933 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 CPMP14384 443 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 MMP11P24347 488 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 KLF10Q13118 480 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 CLN3Q13286 438 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 PGS1Q32NB8 556 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 TMEM205Q6UW68 189 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 RAB43Q86YS6 212 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 TEX37Q96LM6 180 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 DGAT2Q96PD7 388 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 MYLK2Q9H1R3 596 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 NECTIN3Q9NQS3 549 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 C5AR2Q9P296 337 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 ACACAQ13085 2346 aa24.1■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 MYO1GB0I1T2 1018 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 LAMP1P11279 417 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 MAOAP21397 527 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 IL12AP29459 219 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 FRKP42685 505 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 STT3AP46977 705 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 RCAN2Q14206 197 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 MLC1Q15049 377 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 TGIF1Q15583 401 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 SPANXN4Q5MJ08 99 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 C6orf163Q5TEZ5 329 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 OR4N5Q8IXE1 308 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 SHISA5Q8N114 240 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 UCN3Q969E3 161 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 SLC45A3Q96JT2 553 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 ZNF681Q96N22 645 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 RMND5AQ9H871 391 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 ADAP2Q9NPF8 381 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 ACACBO00763 2458 aa24.09■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa24.08■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 OR10H2O60403 315 aa24.08■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 CREG1O75629 220 aa24.08■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 UMODP07911 640 aa24.08■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 MANFP55145 182 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 ZNF385BQ569K4 471 aa24.08■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 CPZQ66K79 652 aa24.08■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 OR9I1Q8NGQ6 314 aa24.08■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 SPDL1Q96EA4 605 aa24.08■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 SLC25A23Q9BV35 468 aa24.08■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 PCDHGB4Q9UN71 923 aa24.08■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 CLDN16Q9Y5I7 305 aa24.08■■□□□ 1.45
STIP1-208ENST00000540501 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 CCDC154A6NI56 674 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 WASHC1A8K0Z3 465 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 IFNA16P05015 189 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 ATP1B1P05026 303 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 IFI6P09912 130 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 LIFP15018 202 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 F8A1P23610 371 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 FEN1P39748 380 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 OR4D2P58180 307 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 TERF2Q15554 542 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 FAM91A1Q658Y4 838 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 ANKRD37Q7Z713 158 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 FUNDC1Q8IVP5 155 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 OR5P2Q8WZ92 322 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 TSLPQ969D9 159 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 ART5Q96L15 291 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 OR52E6Q96RD3 313 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 CCDC106Q9BWC9 280 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 BTNL2Q9UIR0 455 aa24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 A0A1W2PRB8 838 aa24.06■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 RRP8O43159 456 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
STIP1-208ENST00000540501 ID2Q02363 134 aa24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms