RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GDF10P55107 478 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB38P57729 211 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXW4P57775 412 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTG1P63261 375 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBED6P86452 979 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FNDC7Q5VTL7 733 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SBSNQ6UWP8 590 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CES3Q6UWW8 571 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PACS2Q86VP3 889 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM42Q8IWZ5 723 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RHOT2Q8IXI1 618 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR8K1Q8NGG5 319 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF721Q8TF20 911 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXW5Q969U6 566 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 REPS1Q96D71 796 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNF8Q96H20 258 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMIM10Q96HG1 83 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSNARE1Q96NA8 513 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AICDAQ9GZX7 198 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HEY2Q9UBP5 337 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF281Q9Y2X9 895 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1B0GTH6 734 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C2orf72A6NCS6 295 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 E7EVH7 732 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3BMM5 538 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLOD2O00469 737 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTNSO60931 367 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ESR1P03372 595 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NMBRP28336 390 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GCKP35557 465 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLCN7P51798 805 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTLL9Q3SXZ7 439 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM166AQ6J272 317 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AADACL2Q6P093 401 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLEC2AQ6UVW9 174 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCTLQ6UWM7 567 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ENPP6Q6UWR7 440 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYHR1Q6ZMK1 362 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CILP2Q8IUL8 1156 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RFLNBQ8N5W9 214 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABHD11Q8NFV4 315 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4K1Q8NGD4 311 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR14L1PQ8NHC6 308 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCT6BQ92526 530 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM204Q9BSN7 226 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALG2Q9H553 416 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYR61O00622 381 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TP53I11O14683 189 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PJA2O43164 708 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERI3O43414 337 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 B3GALT2O43825 422 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKR1B10O60218 316 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10H2O60403 315 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNX4O95219 450 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VAPBO95292 243 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERPINC1P01008 464 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MPC1LP0DKB6 136 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AHRP35869 848 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLA2G16P53816 162 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPS1Q13098 491 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSHL1Q14406 222 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NR1I3Q14994 352 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NTRK2Q16620 822 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STX1AQ16623 288 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBCELQ5QJ74 424 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRNIPQ6NTE8 343 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MILR1Q7Z6M3 343 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4N5Q8IXE1 308 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPNE9Q8IYJ1 553 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MPP5Q8N3R9 675 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC15A4Q8N697 577 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRPV3Q8NET8 790 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10H5Q8NGA6 315 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUBPLQ8TB37 319 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UCN2Q96RP3 112 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HAUS8Q9BT25 410 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OSBPL8Q9BZF1 889 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OCEL1Q9H607 264 aa9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms