RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SMLR1H3BR10 107 aa6.75□□□□□ -1.33
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 PAGE4O60829 102 aa6.75□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 BRI3O95415 125 aa6.75□□□□□ -1.33
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CFLARO15519 480 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRKYO43930 277 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ANP32DO95626 131 aa6.74□□□□□ -1.33
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 CHRNGP07510 517 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR52Z1P0C646 297 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CDH1P12830 882 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RNH1P13489 461 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ELNP15502 786 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PNLIPP16233 465 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AMPD1P23109 780 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GLRA1P23415 457 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
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