RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531967.5

ECHDC1-222, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-222	ENST00000531967		A0A0A0MQY5	61 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	P2RY10	O00398	339 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PGK1	P00558	417 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TNFSF10	P50591	281 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	RAD23B	P54727	409 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	STX5	Q13190	355 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	STX3	Q13277	289 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	NR1I3	Q14994	352 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CSRP2	Q16527	193 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	DCAF5	Q96JK2	942 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PNKP	Q96T60	521 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	DERL2	Q9GZP9	239 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PARVB	Q9HBI1	364 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PIK3C2G	O75747	1445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	TOR1A	O14656	332 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	C1R	P00736	705 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SP9	P0CG40	484 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SRD5A1	P18405	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	BMP5	P22003	454 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	NDUFS1	P28331	727 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ARL4A	P40617	200 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	RABGGTB	P53611	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	HERV-K104	P63124	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ITIH4	Q14624	930 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SUSD4	Q5VX71	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	NAGS	Q8N159	534 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	OMD	Q99983	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SYT3	Q9BQG1	590 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ADA2	Q9NZK5	511 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMCO1	Q9UM00	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967		A0A0U1RQF3	1178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967		A6NNC1	897 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967		A8MU76	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	STC2	O76061	302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	EPCAM	P16422	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	GNA11	P29992	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CASP14	P31944	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	GK	P32189	559 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	MMP12	P39900	470 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ATP5J2	P56134	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	FKBP1B	P68106	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CYP4F2	P78329	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CDK16	Q00536	496 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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