RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530513.5

PACSIN3-207, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-207ENST00000530513 WHRNQ9P202 907 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM187AA6NFU0 413 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 HCN1O60741 890 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 DIAPH2O60879 1101 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM155BO75949 473 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 LRATO95237 230 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 IST1P53990 364 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 KCNJ2P63252 427 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 PLIN5Q00G26 463 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 TNFRSF17Q02223 184 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 SLAMF1Q13291 335 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 C18orf63Q68DL7 685 aa20.59■□□□□ 0.89
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PACSIN3-207ENST00000530513 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 UBTD2Q8WUN7 234 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 UBE2E3Q969T4 207 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 CMTM7Q96FZ5 175 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 GAL3ST4Q96RP7 486 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 ATOH8Q96SQ7 321 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC6A15Q9H2J7 730 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 PROK2Q9HC23 129 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC24A3Q9HC58 644 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 ALKBH4Q9NXW9 302 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 RNF14Q9UBS8 474 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 SUPT3HB4E1H0 165 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 K7EPI3 171 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 UBXN8O00124 270 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 PLPP1O14494 284 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 SUPT3HO75486 399 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 CALCOCO2Q13137 446 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 TRADDQ15628 312 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC22A10Q63ZE4 541 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 OR4C11Q6IEV9 310 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 GRHL2Q6ISB3 625 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 ISCA2Q86U28 154 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 ZZZ3Q8IYH5 903 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 FBXW8Q8N3Y1 598 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM13CQ8NE31 585 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 OR10G3Q8NGC4 313 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 ZFP64Q9NPA5 681 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 OPTCQ9UBM4 332 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-207ENST00000530513 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 SERPINB1P30740 379 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 RAP1GDS1P52306 607 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 HERVK_113P63132 956 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 ERVK-8P63133 956 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 SLMAPQ14BN4 828 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 DEPDC1Q5TB30 811 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 SEM1Q6ZVN7 128 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 GPR180Q86V85 440 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 MYRIPQ8NFW9 859 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 HUS1BQ8NHY5 278 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 ART5Q96L15 291 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 ERVK-6Q9BXR3 956 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 WWTR1Q9GZV5 400 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 DMRT3Q9NQL9 472 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 ERVK-19Q9WJR5 959 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 DYRK3O43781 588 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 KERAO60938 352 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 CTAG2O75638 210 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 FBXO45P0C2W1 286 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 GABRA1P14867 456 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 PCDH1Q08174 1060 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 EBPQ15125 230 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 ARSKQ6UWY0 536 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 RAPH1Q70E73 1250 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 CTAGE3PQ8IX95 158 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 ULK2Q8IYT8 1036 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 IGSF5Q9NSI5 407 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 MS4A12Q9NXJ0 267 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 PHF11Q9UIL8 331 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 WASHC1A8K0Z3 465 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 CLPSP04118 112 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 TRPC1P48995 793 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 SPRED3Q2MJR0 410 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-207ENST00000530513 RNF111Q6ZNA4 994 aa20.55■□□□□ 0.88
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