RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530405.5

PACSIN3-206, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-206ENST00000530405 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 UBQLN3Q9H347 655 aa14.95□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.95□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.95□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 CRLF1O75462 422 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 TRAPPC6AO75865 159 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 FPR1P21462 350 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 STT3AP46977 705 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 HNMTP50135 292 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 CDKL1Q00532 357 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 TGM3Q08188 693 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 NTRK2Q16620 822 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 GALNT7Q86SF2 657 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 TMEM139Q8IV31 216 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 WDYHV1Q96HA8 205 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 FBXL20Q96IG2 436 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ART5Q96L15 291 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.028e-7■■■□□ 16.4
PACSIN3-206ENST00000530405 VWA7Q9Y334 891 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 DYRK3O43781 588 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 WDR47O94967 919 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 LRATO95237 230 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ACSL3O95573 720 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 KRT14P02533 472 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 MSH2P43246 934 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 CPA2P48052 419 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 KCNC1P48547 511 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 PGGT1BP53609 377 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ID2Q02363 134 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 RCAN2Q14206 197 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 CRYMQ14894 314 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ANKRD7Q92527 254 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 DGAT2Q96PD7 388 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 KCNC2Q96PR1 638 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 SPACA6W5XKT8 324 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 SNX4O95219 450 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 PGAM1P18669 254 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 PTMSP20962 102 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC6A12P48065 614 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 FOXF2Q12947 444 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 CBLBQ13191 982 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 BIKQ13323 160 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ACKR1Q16570 336 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 LUZP2Q86TE4 346 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 DIO2Q92813 273 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 PERPQ96FX8 193 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 F2RL3Q96RI0 385 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 CCL19Q99731 98 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 EGFL8Q99944 293 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 EHD1Q9H4M9 534 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 HRKO00198 91 aa14.91□□□□□ -0.02
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PACSIN3-206ENST00000530405 TP53I11O14683 189 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 FGF17O60258 216 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 RCBTB2O95199 551 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 GDF5P43026 501 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 DCST1Q5T197 706 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM45AQ8TCE6 357 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 RILPQ96NA2 401 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 GNRHR2Q96P88 292 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 TM9SF2Q99805 663 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 GSX2Q9BZM3 304 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 PIGMQ9H3S5 423 aa14.91□□□□□ -0.02
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