RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530120.5

CSRP1-213, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 4

Gene CSRP1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-213	ENST00000530120	STX4	Q12846	297 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	IFT88	Q13099	833 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	RUNX2	Q13950	521 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	RASA2	Q15283	850 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	XKR6	Q5GH73	641 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM47B	Q8NA70	645 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	SGCZ	Q96LD1	299 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PWWP2A	Q96N64	755 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	RBBP8	Q99708	897 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	DLL4	Q9NR61	685 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	SENP1	Q9P0U3	644 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	RNF6	Q9Y252	685 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	DNAJC13	O75165	2243 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120		A0A1B0GTH9	108 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	HS6ST1	O60243	411 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	OR2J2	O76002	312 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TOX	O94900	526 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	IFNA16	P05015	189 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CD1D	P15813	335 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CERS1	P27544	350 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	MAGEA4	P43358	317 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	SLCO1A2	P46721	670 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	RAB10	P61026	200 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	IRF8	Q02556	426 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PCDH1	Q08174	1060 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	NAB1	Q13506	487 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	BMPR2	Q13873	1038 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	DOC2A	Q14183	400 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	OPN5	Q6U736	354 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	RTL4	Q6ZR62	310 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ACAD11	Q709F0	780 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	MDGA2	Q7Z553	956 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	SNX31	Q8N9S9	440 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ART5	Q96L15	291 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	RASL10B	Q96S79	203 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CENPK	Q9BS16	269 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	MS4A8	Q9BY19	250 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CD274	Q9NZQ7	290 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	FETUB	Q9UGM5	382 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	RNF112	Q9ULX5	631 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM120B	A0PK00	339 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM159B	A6NKW6	160 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	BCKDK	O14874	412 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TAPBP	O15533	448 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	HSPA7	P48741	367 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC18A1	P54219	525 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TFF3	Q07654	80 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CHSY3	Q70JA7	882 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	LAS2	Q8IYD9	372 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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