RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 SYNPOQ8N3V7 929 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 B3GNT7Q8NFL0 401 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 UFD1Q92890 307 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 HRASLS5Q96KN8 279 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SORCS2Q96PQ0 1159 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 MAGIXQ9H6Y5 334 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 MARK1Q9P0L2 795 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 LGALS8O00214 317 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ARNTLO00327 626 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 OR4F21O95013 312 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 EGFP01133 1207 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SYPP08247 313 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CD86P42081 329 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 MAGEA2P43356 314 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ARSDP51689 593 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SERINC3Q13530 473 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF234Q14588 700 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 COL19A1Q14993 1142 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 P2RY14Q15391 338 aa9.62□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 TFAP2EQ6VUC0 442 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 BHLHA9Q7RTU4 235 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SLC34A3Q8N130 599 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 STPG2Q8N412 459 aa9.62□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 BTN2A2Q8WVV5 523 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SLC13A3Q8WWT9 602 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ASB12Q8WXK4 309 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 HHATLQ9HCP6 504 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.62□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 RNF112Q9ULX5 631 aa9.62□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 COL4A6Q14031 1691 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 HTTP42858 3142 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CHP2O43745 196 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV3-25P01717 112 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF81P51508 661 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA0040Q15053 153 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF284Q2VY69 593 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC66Q68CR7 880 aa9.62□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 OR4F3Q6IEY1 312 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF549Q6P9A3 640 aa9.62□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 CILP2Q8IUL8 1156 aa9.62□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.62□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 J3KR12 359 aa9.62□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 PLATP00750 562 aa9.62□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 BAMBIQ13145 260 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ARSIQ5FYB1 569 aa9.62□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ZSWIM9Q86XI8 627 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 STK40Q8N2I9 435 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 BMPERQ8N8U9 685 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 AP2M1Q96CW1 435 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 MTERF3Q96E29 417 aa9.62□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 C2orf81A6NN90 581 aa9.61□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 APBB3O95704 486 aa9.61□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SPANXN4Q5MJ08 99 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SLC22A8Q8TCC7 542 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 MYO19Q96H55 970 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 TAPBPLQ9BX59 468 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa9.61□□□□□ -0.87
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