RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516530.1

RNU6-1061P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1061, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1061P, Length 99 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RNU6-1061P-201ENST00000516530 UBN1Q9NPG3 1134 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 GDE1Q9NZC3 331 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 PDP2Q9P2J9 529 aa-0.08□□□□□ -2.42
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