RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 PEX12O00623 359 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PPP6CO00743 305 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF749O43361 778 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 OR2B3O76000 313 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 LDLRP01130 860 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TNNT1P13805 278 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CTNNA2P26232 953 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PSMB4P28070 264 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CETN2P41208 172 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 MAGEA1P43355 309 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ATP5OP48047 213 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 GABRA4P48169 554 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 MARCKSL1P49006 195 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 LMAN1P49257 510 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 DCDP81605 110 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CACNG1Q06432 222 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 KIR2DS3Q14952 304 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 DCAF10Q5QP82 559 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 KCTD11Q693B1 232 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 LCN10Q6JVE6 187 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 C16orf89Q6UX73 402 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 Q6ZS92 163 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 HOOK3Q86VS8 718 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 OR4N4Q8N0Y3 316 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 GALNT16Q8N428 558 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PEX13Q92968 403 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PPM1MQ96MI6 270 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 GBP5Q96PP8 586 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 OSBPL8Q9BZF1 889 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SLC26A1Q9H2B4 701 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 WDR54Q9H977 334 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ICKQ9UPZ9 632 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 HYOU1Q9Y4L1 999 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SEC16AO15027 2179 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 MED13Q9UHV7 2174 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CGB1A6NKQ9 187 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ENO4A6NNW6 628 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 KCNN4O15554 427 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PSMD3O43242 534 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CBX6O95503 412 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 AP2A1O95782 977 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 RPN2P04844 631 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 POLBP06746 335 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CELA2AP08217 269 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 UGT2B7P16662 529 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ACADLP28330 430 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 THBS4P35443 961 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 RAB28P51157 221 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ARSFP54793 590 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 RWDD2BP57060 319 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PTPRCAPQ14761 206 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SPA17Q15506 151 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PARP6Q2NL67 630 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CEP78Q5JTW2 689 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 LINC00523Q86TU6 105 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 LAS2Q8IYD9 372 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SLC34A3Q8N130 599 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TC2NQ8N9U0 490 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 KRT35Q92764 455 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PTERQ96BW5 349 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 OR2A14Q96R47 310 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 HGH1Q9BTY7 390 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.44□□□□□ -1.38
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