RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 SLC34A1Q06495 639 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 MEF2DQ14814 521 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 PPP1R3AQ16821 1122 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 C1orf189Q5VU69 101 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 THNSL1Q8IYQ7 743 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 CCDC197Q8NCU1 140 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 ICA1LQ8NDH6 482 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 OR4F5Q8NH21 305 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 AFAP1L1Q8TED9 768 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
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PDE4D-221ENST00000514231 PNPLA2Q96AD5 504 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 SSX3Q99909 188 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 OR1A2Q9Y585 309 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 PRAMEF12O95522 483 aa3.53□□□□□ -1.84
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PDE4D-221ENST00000514231 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa3.53□□□□□ -1.84
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PDE4D-221ENST00000514231 VN1R17PQ8TDU5 208 aa3.53□□□□□ -1.84
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PDE4D-221ENST00000514231 IL1RL2Q9HB29 575 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
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PDE4D-221ENST00000514231 ELK1P19419 428 aa3.52□□□□□ -1.85
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PDE4D-221ENST00000514231 TGIF1Q15583 401 aa3.52□□□□□ -1.85
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PDE4D-221ENST00000514231 GLRX5Q86SX6 157 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-221ENST00000514231 KLHL7Q8IXQ5 586 aa3.52□□□□□ -1.85
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PDE4D-221ENST00000514231 ZNF559Q9BR84 538 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-221ENST00000514231 SRD5A3Q9H8P0 318 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-221ENST00000514231 CIDEBQ9UHD4 219 aa3.52□□□□□ -1.85
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PDE4D-221ENST00000514231 OOEPA6NGQ2 149 aa3.51□□□□□ -1.85
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PDE4D-221ENST00000514231 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-221ENST00000514231 FAF2Q96CS3 445 aa3.51□□□□□ -1.85
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PDE4D-221ENST00000514231 PRKAR2BP31323 418 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-221ENST00000514231 MPP7Q5T2T1 576 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-221ENST00000514231 LRRC38Q5VT99 294 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-221ENST00000514231 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa3.5□□□□□ -1.85
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PDE4D-221ENST00000514231 GJB5O95377 273 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-221ENST00000514231 FRKP42685 505 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-221ENST00000514231 ARHGDIAP52565 204 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-221ENST00000514231 NDST1P52848 882 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-221ENST00000514231 MFAP2P55001 183 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-221ENST00000514231 P2RY14Q15391 338 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-221ENST00000514231 UNC50Q53HI1 259 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-221ENST00000514231 FAM219BQ5XKK7 198 aa3.49□□□□□ -1.85
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