RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 CAVIN3Q969G5 261 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 APOPT1Q96IL0 206 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 BRF2Q9HAW0 419 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MID1IP1Q9NPA3 183 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CYSRT1A8MQ03 144 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFAND5O76080 213 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV3-11P04433 115 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SP1P08047 785 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CD46P15529 392 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 HMOX2P30519 316 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SOX3P41225 446 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ERVK-8P63133 956 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF4P78317 190 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 HMGCS1Q01581 520 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC153Q494R4 210 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 RNFT1Q5M7Z0 435 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 EMBQ6PCB8 327 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 HSDL2Q6YN16 418 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MDGA2Q7Z553 956 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TRABD2AQ86V40 505 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC63Q8NA47 563 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 RASL10BQ96S79 203 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CNPPD1Q9BV87 410 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 LGALS13Q9UHV8 139 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAM29Q9UKF5 820 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ERVK-19Q9WJR5 959 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0G2JMM0 328 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PPB8 328 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PRS3 328 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ASPDHA6ND91 283 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 KIR3DP1A8MWS1 328 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 OR6B1O95007 311 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ESRRBO95718 433 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR75O95800 540 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MLYCDO95822 493 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CT62P0C5K7 136 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 COX7A2P14406 83 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CREB1P16220 341 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 RFC3P40938 356 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SSR4P51571 173 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MAPK12P53778 367 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 NAGLUP54802 743 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 RAE1P78406 368 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 DUSP2Q05923 314 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MAPKAPK3Q16644 382 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A25Q6KCM7 469 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM180BQ6P0A1 224 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM178AQ8NBL3 297 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 METTL6Q8TCB7 284 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB9Q96C00 473 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 APIPQ96GX9 242 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 EBPLQ9BY08 206 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 PARD6BQ9BYG5 372 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 OXSMQ9NWU1 459 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC17A7Q9P2U7 560 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MYOTQ9UBF9 498 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 OSGIN2Q9Y236 505 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF407Q9C0G0 2248 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNHIT1O43257 154 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10H2O60403 315 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SPAG7O75391 227 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 UNC5CO95185 931 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT6AP02538 564 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT6BP04259 564 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ENO1P06733 434 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 FREM3P0C091 2139 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CCT5P48643 541 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT6CP48668 564 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 PKNOX1P55347 436 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR85P60893 370 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SPRED3Q2MJR0 410 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MYO7BQ6PIF6 2116 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 PAGE2Q7Z2X7 111 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 C10orf107Q8IVU9 208 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM156Q8N614 296 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 BANPQ8N9N5 519 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 RDH11Q8TC12 318 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXL20Q96IG2 436 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MECRQ9BV79 373 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR41Q9HAD4 459 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 DEPPQ9NTK1 212 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MKS1Q9NXB0 559 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 AHSPQ9NZD4 102 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 COPS7AQ9UBW8 275 aa17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms