RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2-212ENST00000508338 ATMQ13315 3056 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 GLOD5A6NK44 160 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 CDK2AP1O14519 115 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 DYNC1I1O14576 645 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 PGRMC2O15173 223 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 HDAC3O15379 428 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 OR10H2O60403 315 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 ALDH9A1P49189 494 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 C6orf163Q5TEZ5 329 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 PCSK4Q6UW60 755 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 VMP1Q96GC9 406 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 C7orf26Q96N11 449 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 CES1P1Q9UKY3 287 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 C17orf105B2RV13 164 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 DDCP20711 480 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 CLCN2P51788 898 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 XKP51811 444 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 OR4N5Q8IXE1 308 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 LGI4Q8N135 537 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC5A8Q8N695 610 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 ELP5Q8TE02 316 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 MAGEB18Q96M61 343 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 LMF1Q96S06 567 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 NUDT9Q9BW91 350 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 MEAF6Q9HAF1 191 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 KCNK13Q9HB14 408 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 MIEF1Q9NQG6 463 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 A8MUA0 341 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 PEX11AO75192 247 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 PRPS2P11908 318 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 PORP16435 677 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 RPL3P39023 403 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 ID2Q02363 134 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 C2orf80Q0P641 193 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 SPRED3Q2MJR0 410 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 C6orf136Q5SQH8 315 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM71E1Q6IPT2 247 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 H3F3CQ6NXT2 135 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 ISLR2Q6UXK2 745 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM9CQ8IZT9 166 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 FNDC5Q8NAU1 212 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC39A7Q92504 469 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHL29Q96CT2 875 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 C3orf30Q96M34 536 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 EPS8L2Q9H6S3 715 aa25.05■■□□□ 1.6
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SH3BP2-212ENST00000508338 PNPOQ9NVS9 261 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 TAS2R7Q9NYW3 318 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 COPS7AQ9UBW8 275 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 UTS2RQ9UKP6 389 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 MAPRE3Q9UPY8 281 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 CROCCQ5TZA2 2017 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP6AP2O75787 350 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 ITGAMP11215 1152 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 CPMP14384 443 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 EMX2Q04743 252 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 RGS9BPQ6ZS82 235 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 CKAP2Q8WWK9 683 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 RIT1Q92963 219 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF354BQ96LW1 612 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 ASIC5Q9NY37 505 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 ENTPD4Q9Y227 616 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 MASP2O00187 686 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 DPM1O60762 260 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 SDC1P18827 310 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 LY6DQ14210 128 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 IGFL3Q6UXB1 125 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 ASB18Q6ZVZ8 466 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 OR1N1Q8NGS0 311 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 CDC26Q8NHZ8 85 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 MTERF3Q96E29 417 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 FBXL20Q96IG2 436 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 NUF2Q9BZD4 464 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 SEMA4CQ9C0C4 833 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 ABI3Q9P2A4 366 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 HEY2Q9UBP5 337 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 IGSF10Q6WRI0 2623 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP1B1P05026 303 aa25.02■■□□□ 1.6
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