RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ANO10	Q9NW15	660 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ACOD1	A6NK06	481 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284		K7EQG2	157 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CS	O75390	466 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	REC8	O95072	547 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	MMP10	P09238	476 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	PITPNB	P48739	271 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CCR4	P51679	360 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	PEX3	P56589	373 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	LYG1	Q8N1E2	194 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	GLYATL1	Q969I3	302 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	NABP1	Q96AH0	204 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM237	Q96Q45	408 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TAAR6	Q96RI8	345 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	WWP1	Q9H0M0	922 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TNMD	Q9H2S6	317 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	PIGV	Q9NUD9	493 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	PRDM2	Q13029	1718 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SHISA9	B4DS77	424 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CCS	O14618	274 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	KIAA0513	O60268	411 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ANXA9	O76027	345 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	OR6A2	O95222	327 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CXCL14	O95715	111 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC4A1	P02730	911 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CT45A8	P0DMV1	189 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CT45A9	P0DMV2	189 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	AHCY	P23526	432 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ID1	P41134	155 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	FHIT	P49789	147 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC12A3	P55017	1021 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	OR1C1	Q15619	314 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CARTPT	Q16568	116 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ECSCR	Q19T08	205 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TEX35	Q5T0J7	233 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	RTL6	Q6ICC9	239 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	NEPRO	Q6NW34	567 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	BATF2	Q8N1L9	274 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	LEMD2	Q8NC56	503 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TCP11	Q8WWU5	503 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SPX	Q9BT56	116 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	CARD9	Q9H257	536 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	GAN	Q9H2C0	597 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	NMUR1	Q9HB89	426 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	GDF3	Q9NR23	364 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	DEPP	Q9NTK1	212 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	THYN1	Q9P016	225 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRK-215	ENST00000498284	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84

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