RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	SHE	Q5VZ18	495 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TRIL	Q7L0X0	811 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TRABD2A	Q86V40	505 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ESAM	Q96AP7	390 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	HAUS8	Q9BT25	410 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	WWOX	Q9NZC7	414 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344		A8MVJ9	347 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	INAFM1	C9JVW0	142 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344		H7C1Q1	480 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	GLRA3	O75311	464 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	WDR47	O94967	919 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	B3GALT4	O96024	378 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	IGHG3	P01860	377 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	HRH2	P25021	359 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CRHR1	P34998	444 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	GDF5	P43026	501 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	MAGEA5	P43359	124 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SLC6A12	P48065	614 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	HSPA7	P48741	367 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SSR4	P51571	173 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CLCN2	P51788	898 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	PPP2R2B	Q00005	443 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	HERC3	Q15034	1050 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	PFKFB4	Q16877	469 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	C17orf64	Q86WR6	236 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ZBTB9	Q96C00	473 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	LRRC46	Q96FV0	321 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	OR4K3	Q96R72	315 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SH3GL2	Q99962	352 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	HPF1	Q9NWY4	346 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	XPR1	Q9UBH6	696 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	FREM3	P0C091	2139 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	AQP7	O14520	342 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	COPE	O14579	308 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ARHGEF9	O43307	516 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SMIM24	O75264	130 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	STK16	O75716	305 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SBK3	P0C264	359 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	GFAP	P14136	432 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CD53	P19397	219 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	BMP5	P22003	454 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	MAN2A2	P49641	1150 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ASCL1	P50553	236 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	DEFB134	Q4QY38	66 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344		Q5PR19	223 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	WLS	Q5T9L3	541 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CD244	Q9BZW8	370 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CENPH	Q9H3R5	247 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	LDAH	Q9H6V9	325 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TMCO1	Q9UM00	188 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1B0GVC2	190 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms