RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487251.5

LRRC1-203, Transcript of leucine rich repeat containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LRRC1, Length 2,527 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1-203ENST00000487251 ITGAMP11215 1152 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 RAB8AP61006 207 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 ZNF750Q32MQ0 723 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 SZRD1Q7Z422 152 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 HMGB4Q8WW32 186 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 LCN9Q8WX39 176 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 NEURL3Q96EH8 262 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 WDR92Q96MX6 357 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 KRT84Q9NSB2 600 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 SHISA7A6NL88 538 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 BTN3A3O00478 584 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 XPNPEP2O43895 674 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 BCHEP06276 602 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 GABRG2P18507 467 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 GRK3P35626 688 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 TUBA3CQ13748 450 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 RFX4Q33E94 735 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 SPDYE7PQ495Y7 208 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 IFI44LQ53G44 452 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 AMIGO1Q86WK6 493 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 SPARTQ8N0X7 666 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 FUNDC2Q9BWH2 189 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 CLDN25C9JDP6 229 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 SLC19A1P41440 591 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 SLAMF1Q13291 335 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 TP53BP2Q13625 1128 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 CCDC80Q76M96 950 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 C6orf120Q7Z4R8 191 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 UBE2FQ969M7 185 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 SERHL2Q9H4I8 314 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 FBXW2Q9UKT8 454 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 MTCH2Q9Y6C9 303 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 PGRMC2O15173 223 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 TBX19O60806 448 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 CERS1P27544 350 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 FRKP42685 505 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 DUSP7Q16829 419 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 SLC38A5Q8WUX1 472 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 MAGED4Q96JG8 741 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 EPYCQ99645 322 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 GLIPR2Q9H4G4 154 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 PRDM7Q9NQW5 492 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 ATG4BQ9Y4P1 393 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 PTGES3LE9PB15 166 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 SLC1A7O00341 560 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 TOR1BO14657 336 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 RECKO95980 971 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 HTR1BP28222 390 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 FMO3P31513 532 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 GSSP48637 474 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 CDH12P55289 794 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 CDK5R2Q13319 367 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 CRB2Q5IJ48 1285 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 OLIG3Q7RTU3 272 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 SFTPA2Q8IWL1 248 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 HPS1Q92902 700 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 DGCR6LQ9BY27 220 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 RLIMQ9NVW2 624 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 ADAM29Q9UKF5 820 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 ANGPT4Q9Y264 503 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 TNFRSF11BO00300 401 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 SH3BP5O60239 455 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 KDM1AO60341 852 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 SPIBQ01892 262 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 DUSP2Q05923 314 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 ZNF846Q147U1 533 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 FAHD1Q6P587 224 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 ABHD17CQ6PCB6 329 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 PATE1Q8WXA2 126 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 ASB12Q8WXK4 309 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 TMEM19Q96HH6 336 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 NECTIN4Q96NY8 510 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 AKIP1Q9NQ31 210 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 A0A1W2PR48 441 aa21.46■■□□□ 1.03
LRRC1-203ENST00000487251 GSTM2P28161 218 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms