RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
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PRAME-212ENST00000485532 SBK3P0C264 359 aa11.71□□□□□ -0.53
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PRAME-212ENST00000485532 PLSCR2Q9NRY7 297 aa11.71□□□□□ -0.53
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PRAME-212ENST00000485532 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa11.71□□□□□ -0.53
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PRAME-212ENST00000485532 LIPGQ9Y5X9 500 aa11.71□□□□□ -0.53
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PRAME-212ENST00000485532 C17orf105B2RV13 164 aa11.7□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 ETHE1O95571 254 aa11.7□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 OR4N5Q8IXE1 308 aa11.7□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 ACOT4Q8N9L9 421 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 PDPRQ8NCN5 879 aa11.7□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 SLC2A12Q8TD20 617 aa11.7□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 ATOH8Q96SQ7 321 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 SPOCK3Q9BQ16 436 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 CAPS2Q9BXY5 557 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 MS4A8Q9BY19 250 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 TTTY12Q9BZ98 90 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 CD244Q9BZW8 370 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 PNPLA3Q9NST1 481 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 COQ3Q9NZJ6 369 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 VTI1BQ9UEU0 232 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 RNF112Q9ULX5 631 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 CCDC189A1A4V9 331 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 NPIPA2E9PIF3 369 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 NPIPA3F8WFD2 350 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 G3V2L1 256 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 UBXN8O00124 270 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 KERAO60938 352 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 CELA3AP09093 270 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 PCNAP12004 261 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 TNNI3P19429 210 aa11.69□□□□□ -0.54
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