RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR5M3Q8NGP4 307 aa16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLRF1Q9NZS2 232 aa16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTTG1O95997 202 aa16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPRED3Q2MJR0 410 aa16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NDNFQ8TB73 568 aa16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 THAP4Q8WY91 577 aa16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C16orf70Q9BSU1 422 aa16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACTL8Q9H568 366 aa16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM184CQ9NVA4 438 aa16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SOBPA7XYQ1 873 aa16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GAS6Q14393 721 aa16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MFSD8Q8NHS3 518 aa16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HCAR2Q8TDS4 363 aa16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WASHC1A8K0Z3 465 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MITFO75030 526 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNFP01375 233 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ALPPL2P10696 532 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RHCEP18577 417 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACTC1P68032 377 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACTA1P68133 377 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WASH2PQ6VEQ5 465 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WDTC1Q8N5D0 677 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DCAF4L2Q8NA75 395 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DEDD2Q8WXF8 326 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR2S2Q9NQN1 319 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 B4GALT6Q9UBX8 382 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMCO3A2RU48 225 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A6NHS1 94 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 H3BMQ9 156 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AHSA1O95433 338 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BMP2P12643 396 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDGFRLQ15198 375 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM217AQ8IXS0 508 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COG8Q96MW5 612 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOLH1BQ9HBA9 442 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRKYO43930 277 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSD17B1P14061 328 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DCKP27707 260 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR4D1Q15615 310 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C2orf27AQ580R0 203 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UGT2A3Q6UWM9 527 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABHD11Q8NFV4 315 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRR1Q96L50 414 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C1orf74Q96LT6 269 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYT4Q9H2B2 425 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MCCC2Q9HCC0 563 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IFNA2P01563 188 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FLYWCH1Q4VC44 716 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RANBP9Q96S59 729 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HDHD5Q9BXW7 423 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NLKQ9UBE8 527 aa16.44■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 H7BY64 318 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPM1BO75688 479 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CYP17A1P05093 508 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD9P21926 228 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACRV1P26436 265 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHRFAM7AQ494W8 412 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CES4AQ5XG92 561 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR56A3Q8NH54 315 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBXO27Q8NI29 283 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRAP1Q96NZ9 151 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIB3Q96RU7 358 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR10A4Q9H209 315 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLF15Q9UIH9 416 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MUSKO15146 869 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NR4A2P43354 598 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LBX1P52954 281 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAS1R3Q7RTX0 852 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRSS48Q7RTY5 328 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIF18BQ86Y91 864 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 METTL25Q8N6Q8 603 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR4K3Q96R72 315 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TXLNGYQ9BZA5 131 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACSL6Q9UKU0 697 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1W2PPL8 197 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MTFR2Q6P444 385 aa16.43■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BEND4Q6ZU67 534 aa16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms