RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	ERVK-8	P63133	956 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	LCP2	Q13094	533 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	IMPG1	Q17R60	797 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	RIT1	Q92963	219 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	UCN3	Q969E3	161 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ART5	Q96L15	291 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	KCNA7	Q96RP8	456 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	HPF1	Q9NWY4	346 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	EMCN	Q9ULC0	261 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880		A1L4Q6	167 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880		G3V2L1	256 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PGRMC2	O15173	223 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PLIN3	O60664	434 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	GUCY1B2	O75343	617 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	NEURL1	O76050	574 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	DDAH2	O95865	285 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	CPA3	P15088	417 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	NT5E	P21589	574 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	CRHR1	P34998	444 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	RFC3	P40938	356 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	HTR6	P50406	440 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	GPR143	P51810	404 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PKNOX1	P55347	436 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	GPR85	P60893	370 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	RNF4	P78317	190 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	EMB	Q6PCB8	327 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	METTL4	Q8N3J2	472 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	BRF2	Q9HAW0	419 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	MID2	Q9UJV3	735 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF225	Q9UK10	706 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PPT2	Q9UMR5	302 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	HRK	O00198	91 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	LRRTM2	O43300	516 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	NME2P1	O60361	137 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	CHN1	P15882	459 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF24	P17028	368 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	NME2	P22392	152 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	MST1	P26927	711 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SOX3	P41225	446 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	HK2	P52789	917 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	HMGCS1	Q01581	520 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	RBPJ	Q06330	500 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ASPH	Q12797	758 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	BIK	Q13323	160 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF721	Q8TF20	911 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ZBTB9	Q96C00	473 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SCMH1	Q96GD3	660 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	MYOT	Q9UBF9	498 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SSR4-208	ENST00000471880	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21

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