RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 ACTR8Q9H981 624 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 VAT1LQ9HCJ6 419 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 LHX3Q9UBR4 397 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 BCAP29Q9UHQ4 241 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 MGAT4BQ9UQ53 548 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ZMYM6O95789 1325 aa3.96□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 NPIPB9F8W1W9 429 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 K7EQD1 137 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 IKBKBO14920 756 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 TNFSF12O43508 249 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 BUB1O43683 1085 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF432O94892 652 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ZCCHC18P0CG32 403 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 GP9P14770 177 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 IL4RP24394 825 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 MMP12P39900 470 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 NPY2RP49146 381 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 CYCSP99999 105 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 DHODHQ02127 395 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 HSF2Q03933 536 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 RBBP4Q09028 425 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 FUT7Q11130 342 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 P2RY14Q15391 338 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 DCAF12Q5T6F0 453 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 CES4AQ5XG92 561 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 MISPQ8IVT2 679 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM37Q8WXS4 190 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 PGLYRP2Q96PD5 576 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 FICDQ9BVA6 458 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 MED20Q9H944 212 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 NMUR1Q9HB89 426 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 NLGN3Q9NZ94 848 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 MIOXQ9UGB7 285 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ATG4BQ9Y4P1 393 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 FGD5Q6ZNL6 1462 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR81Q562E7 1941 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 OR5H15A6NDH6 313 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 MEI4A8MW99 385 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 LGALS8O00214 317 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 SH2D1BO14796 132 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ANGPT2O15123 496 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 INPP4BO15327 924 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 CHADO15335 359 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 TOM1L1O75674 476 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 CLDN1O95832 211 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 FCER2P06734 321 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 RRASP10301 218 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ADSSP30520 456 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 TRPC1P48995 793 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 NDST1P52848 882 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 CRYBA2P53672 197 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 RPL27P61353 136 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ZSWIM7Q19AV6 140 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 WLSQ5T9L3 541 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 NEPROQ6NW34 567 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 BHLHB9Q6PI77 547 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM65Q6PJ69 517 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 FRRS1Q6ZNA5 592 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 Q6ZRP5 223 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 NR2C2APQ86WQ0 139 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 OR10G7Q8NGN6 311 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 DEFB118Q96PH6 123 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ACCSQ96QU6 501 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 USP28Q96RU2 1077 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 NDUFAF3Q9BU61 184 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNK13Q9HB14 408 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM181Q9P2C4 612 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ATXN10Q9UBB4 475 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF175Q9Y473 711 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF215Q9Y6U7 377 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 KIF7Q2M1P5 1343 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A1B0GWJ7 208 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 TMCO5BA8MYB1 307 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 PDXKO00764 312 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 LANCL1O43813 399 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 TSPAN2O60636 221 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 VPS26AO75436 327 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 FHP07954 510 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 PTPN4P29074 926 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 PTPN6P29350 595 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RABGGTB-207ENST00000470201 FCGR2CP31995 323 aa3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms