RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468468.5

TSPAN4-211, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-211ENST00000468468 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 EN2P19622 333 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 TNFSF8P32971 234 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 SOX3P41225 446 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 SEC23BQ15437 767 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 BCL7AQ4VC05 210 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 GPR32P1Q8NGA4 272 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 UBE2E3Q969T4 207 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 CLEC2DQ9UHP7 191 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 A0A075B6Q4 140 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 H3BN98 237 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 RGS5O15539 181 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 OR10H3O60404 316 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 SCG5P05408 212 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 CD72P21854 359 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 DGKGP49619 791 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 RHAGQ02094 409 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 NDUFA5Q16718 116 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 DCST1Q5T197 706 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC9B2Q86UD5 537 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 OR8H2Q8N162 312 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 IL17RDQ8NFM7 739 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 KLHL6Q8WZ60 621 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 RAB8BQ92930 207 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 DTD2Q96FN9 168 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 TMEM19Q96HH6 336 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 ACAT2Q9BWD1 397 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 SMURF1Q9HCE7 757 aa15□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 SOD1P00441 154 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 TIE1P35590 1138 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 ILKQ13418 452 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 SAXO2Q658L1 398 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 NEURL3Q96EH8 262 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 TMEM80Q96HE8 168 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 CCDC32Q9BV29 185 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 FZD3Q9NPG1 666 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 MOSPD1Q9UJG1 213 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 PI15O43692 258 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 CSO75390 466 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 MFN2O95140 757 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 LBX1P52954 281 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 METAP1P53582 386 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 MESP2Q0VG99 397 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 DEF8Q6ZN54 512 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 C12orf40Q86WS4 652 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 FLCNQ8NFG4 579 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 COQ10AQ96MF6 247 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 ABCG4Q9H172 646 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 DYRK4Q9NR20 520 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 MGAT4BQ9UQ53 548 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 SEMA7AO75326 666 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 POP7O75817 140 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 NFE2L1Q14494 772 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 DHCR24Q15392 516 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 SPHARQ15513 63 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 RAET1GQ6H3X3 334 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 CASP12Q6UXS9 341 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 KRT73Q86Y46 540 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 C7orf61Q8IZ16 206 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 C3orf14Q9HBI5 128 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 AHSPQ9NZD4 102 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 USP34Q70CQ2 3546 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 PLPP1O14494 284 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 CYP7B1O75881 506 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 CCNKO75909 580 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPAN4-211ENST00000468468 SLITRK5O94991 958 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms