RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 HTR6P50406 440 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ACSM2AQ08AH3 577 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 NR6A1Q15406 480 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 IMPG1Q17R60 797 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SPIN4Q56A73 249 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ACSM2BQ68CK6 577 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 CROCCP2Q86T23 111 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 C10orf107Q8IVU9 208 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 HOMEZQ8IX15 550 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 MDS2Q8NDY4 140 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 OR5L2Q8NGL0 311 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 OR8K3Q8NH51 312 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM125Q96AQ2 219 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM111AQ96PZ2 611 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNA7Q96RP8 456 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 TRMOQ9BU70 441 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 FAIM2Q9BWQ8 316 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ACPTQ9BZG2 426 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 OLAHQ9NV23 265 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 MCM8Q9UJA3 840 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 C1orf226A1L170 272 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SERTM1A2A2V5 107 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ERLIN1O75477 346 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ITGA10O75578 1167 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC35E2P0CK97 266 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 GALNSP34059 522 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 DEKP35659 375 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 UQCRFS1P47985 274 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 HLCSP50747 726 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SSR4P51571 173 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF844Q08AG5 666 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 C6orf163Q5TEZ5 329 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SPINK14Q6IE38 97 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 OR4K14Q8NGD5 310 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 DNAJB8Q8NHS0 232 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 TCP10LQ8TDR4 215 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 CHTF18Q8WVB6 975 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 RIT1Q92963 219 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 FBXL20Q96IG2 436 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 KLHL1Q9NR64 748 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PSME2Q9UL46 239 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 GTF3C1Q12789 2109 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKUB1A6NFN9 424 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 GOLGA6L10A6NI86 522 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PGRMC2O15173 223 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PCDH7O60245 1069 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC25A12O75746 678 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 UROSP10746 265 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 EDN3P14138 238 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 CHN1P15882 459 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ST13P50502 369 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 FOXA1P55317 472 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF4P78317 190 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 HMGCS1Q01581 520 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SPRED3Q2MJR0 410 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SPDYAQ5MJ70 313 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM219BQ5XKK7 198 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC25A25Q6KCM7 469 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF721Q8TF20 911 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ASB15Q8WXK1 588 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 TM4SF18Q96CE8 201 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SCMH1Q96GD3 660 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 TAAR6Q96RI8 345 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 CNPPD1Q9BV87 410 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC17A7Q9P2U7 560 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 MYOTQ9UBF9 498 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRK2Q5S007 2527 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 WASHC1A8K0Z3 465 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 A8MVJ9 347 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 NPHS1O60500 1241 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 OR2J2O76002 312 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 NEURL1O76050 574 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 CBX6O95503 412 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 CHEK2O96017 543 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 SP1P08047 785 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 MYZAPP0CAP1 466 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ALDH3A1P30838 453 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms