RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464322.5

CENPF-202, Transcript of centromere protein F, humanhuman

TSL 2

Gene CENPF, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-202ENST00000464322 F2RL3Q96RI0 385 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 SH2D2AQ9NP31 389 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 NDRG3Q9UGV2 375 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 IKZF3Q9UKT9 509 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 SONP18583 2426 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 TRIM64A6NGJ6 449 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 TRIM64BA6NI03 449 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CDC7O00311 574 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 C1QAP02745 245 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CPN2P22792 545 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 GSTM2P28161 218 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 ADGRD1Q6QNK2 874 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 SLC29A4Q7RTT9 530 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 C9orf40Q8IXQ3 194 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 SMPDL3BQ92485 455 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 PERPQ96FX8 193 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 ART5Q96L15 291 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 KRT12Q99456 494 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 ROGDIQ9GZN7 287 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 PROK2Q9HC23 129 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 LYRM4Q9HD34 91 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 SLC17A6Q9P2U8 582 aa13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 A0A1W2PPR1 153 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CD8B2A6NJW9 211 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 TP53I11O14683 189 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 SH3BGRLO75368 114 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 IL18BPO95998 194 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 BMP7P18075 431 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CXCR5P32302 372 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 KCNC1P48547 511 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 HNMTP50135 292 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CBLBQ13191 982 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 AP5B1Q2VPB7 878 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 FAM45BPQ6NSW5 357 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 PACS2Q86VP3 889 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 TAGAPQ8N103 731 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 SNX31Q8N9S9 440 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 C7orf57Q8NEG2 295 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 FAM45AQ8TCE6 357 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 KCNC2Q96PR1 638 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CCL19Q99731 98 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CAPS2Q9BXY5 557 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 PRDM14Q9GZV8 571 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 UBTD1Q9HAC8 227 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 PRDM7Q9NQW5 492 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 GALNT8Q9NY28 637 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 TRPS1Q9UHF7 1281 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 ROS1P08922 2347 aa13.05□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CAPN14A8MX76 684 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 HRKO00198 91 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 RTCAO00442 366 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 FGF17O60258 216 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 TTC4O95801 387 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 FBXO45P0C2W1 286 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CYP4B1P13584 511 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 GCKP35557 465 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 MAGEA3P43357 314 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 STT3AP46977 705 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CDK9P50750 372 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 PLIN5Q00G26 463 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 ADPRMQ3LIE5 342 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 EIPR1Q53HC9 387 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 SPANXN3Q5MJ09 141 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 TBCELQ5QJ74 424 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 VASNQ6EMK4 673 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 ADNP2Q6IQ32 1131 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 LYPD8Q6UX82 237 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 TMEM64Q6YI46 380 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 TMEM139Q8IV31 216 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 ACOT4Q8N9L9 421 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 C9orf106Q8NAJ2 232 aa13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms