RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 S1PR1P21453 382 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 TLR1Q15399 786 aa6.51□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 MID1IP1Q9NPA3 183 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 OXSMQ9NWU1 459 aa6.51□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 LCP2Q13094 533 aa6.5□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 DESI1Q6ICB0 168 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZSR9 355 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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