RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCNAP12004 261 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 CPN2P22792 545 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHRNB4P30926 498 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 HPDP32754 393 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOX18P35713 384 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIGAP37287 484 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADH7P40394 386 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 SSR2P43308 183 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAGEA4P43358 317 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 DLX5P56178 289 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLGLB1Q02325 96 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 PMPCAQ10713 525 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 CALCOCO2Q13137 446 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLAMF1Q13291 335 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLMAPQ14BN4 828 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPRED3Q2MJR0 410 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM35AQ53FP2 167 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 TECRLQ5HYJ1 363 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTAGE3PQ8IX95 158 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 TEX9Q8N6V9 391 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 RHEBL1Q8TAI7 183 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASB5Q8WWX0 329 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 CMTM7Q96FZ5 175 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXL20Q96IG2 436 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM173AQ9BQD7 235 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTYH2Q9BSA4 534 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL1RL2Q9HB29 575 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 NMRAL1Q9HBL8 299 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 SACM1LQ9NTJ5 587 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF358Q9NW07 568 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 COQ3Q9NZJ6 369 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 OPTCQ9UBM4 332 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 NF1P21359 2839 aa7.79□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A0G2JNJ9 132 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1B0GTL3 188 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1W2PR48 441 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ESYT3A0FGR9 886 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR14I1A6ND48 311 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 H0YIV9 168 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACOT7O00154 380 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR7A17O14581 309 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 PROM1O43490 865 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRATO95237 230 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 AIFM1O95831 613 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 CT62P0C5K7 136 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNNI3P19429 210 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 CAPN3P20807 821 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACVR2AP27037 513 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIK3CBP42338 1070 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAGEA12P43365 314 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIK3CGP48736 1102 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARFIP1P53367 373 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC37A1P57057 533 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 HERVK_113P63132 956 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERVK-8P63133 956 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 TGM3Q08188 693 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 NAB1Q13506 487 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 RCN2Q14257 317 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRAMEF20Q5VT98 475 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM211Q6ICI0 200 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 OPN5Q6U736 354 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 RGS9BPQ6ZS82 235 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 GK5Q6ZS86 529 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM47EQ6ZV65 393 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHSY3Q70JA7 882 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDH24Q86UP0 819 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR180Q86V85 440 aa7.78□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC25Q86WR0 208 aa7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms