RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 NFU1Q9UMS0 254 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 DAPP1Q9UN19 280 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 A0A1W2PPR1 153 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CD8B2A6NJW9 211 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CLCA1A8K7I4 914 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 C17orf105B2RV13 164 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ARHGEF9O43307 516 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ETHE1O95571 254 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 TTC4O95801 387 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 GUCA1CO95843 209 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 KRT14P02533 472 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 C1QAP02745 245 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 IFNA16P05015 189 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 FBXO45P0C2W1 286 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 GNAZP19086 355 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SLC6A12P48065 614 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 FNTAP49354 379 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 HNMTP50135 292 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 MTTPP55157 894 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 DR1Q01658 176 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ASPHQ12797 758 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 BIKQ13323 160 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CRYMQ14894 314 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 VASNQ6EMK4 673 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 TMPRSS11BQ86T26 416 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 NAT8LQ8N9F0 302 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 LINC01560Q8TB33 94 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 NUDT8Q8WV74 236 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SMPDL3BQ92485 455 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 NTNG2Q96CW9 530 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CSF3RQ99062 836 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 TIMP4Q99727 224 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 TSPYL1Q9H0U9 437 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 EHD1Q9H4M9 534 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 EXO5Q9H790 373 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CALHM2Q9HA72 323 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 VWA7Q9Y334 891 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 A0A0G2JN53 185 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SCELO95171 688 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 IL2RAP01589 272 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 PGAM1P18669 254 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SAT1P21673 171 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CTSSP25774 331 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 OPRM1P35372 400 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 PCYT1AP49585 367 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 VPS41P49754 854 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 PLA2G16P53816 162 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 KCNJ2P63252 427 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 STX4Q12846 297 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 DUSP8Q13202 625 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 TTC27Q6P3X3 843 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 C9orf40Q8IXQ3 194 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 KRT78Q8N1N4 520 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 BBOF1Q8ND07 529 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SLC22A8Q8TCC7 542 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ISL2Q96A47 359 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 WDR34Q96EX3 536 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms