RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 NUDT8Q8WV74 236 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ELP4Q96EB1 424 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 C10orf90Q96M02 699 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 RNF145Q96MT1 663 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PCDHAC1Q9H158 963 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 GLIPR2Q9H4G4 154 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 EPS8L2Q9H6S3 715 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 FGF21Q9NSA1 209 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CUTCQ9NTM9 273 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 GIN1Q9NXP7 522 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ERVK-11Q9UQG0 969 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 MMACHCQ9Y4U1 282 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PQM1 296 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 A8MUI8 341 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM150CB9EJG8 249 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 C4orf51C9J302 202 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CXCR6O00574 342 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ARPC2O15144 300 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 FOXS1O43638 330 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ASNA1O43681 348 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SH3BP5O60239 455 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PLOD3O60568 738 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CREG1O75629 220 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ATP1B1P05026 303 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CYC1P08574 325 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CPMP14384 443 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ANPEPP15144 967 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CRATP43155 626 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 GCGRP47871 477 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SEPHS1P49903 392 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 MAP4K2Q12851 820 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CYP51A1Q16850 503 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SPDYE7PQ495Y7 208 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC80Q76M96 950 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 GPR155Q7Z3F1 870 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SPPL2CQ8IUH8 684 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CATSPER1Q8NEC5 780 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 OR9A4Q8NGU2 314 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF675Q8TD23 568 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 RASSF5Q8WWW0 418 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 TBC1D20Q96BZ9 403 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SLC45A3Q96JT2 553 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 MAGIXQ9H6Y5 334 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SYNPO2LQ9H987 977 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF304Q9HCX3 659 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM9BQ9NQ34 198 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 C8orf4Q9NR00 106 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 FBXO8Q9NRD0 319 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 FTSJ1Q9UET6 329 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 KLHL3Q9UH77 587 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 RARRES3Q9UL19 164 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 LIPT1Q9Y234 373 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 R4GN57 208 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SCN2AQ99250 2005 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 DHRS12A0PJE2 317 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 LNP1A1A4G5 178 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 A8MU76 341 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 I3L1I5 382 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SGK494L7N484 410 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF749O43361 778 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 DYRK3O43781 588 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 TNFRSF21O75509 655 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PDE9AO76083 593 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 NTRK1P04629 796 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 FGF5P12034 268 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 FOLR1P15328 257 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 MATN1P21941 496 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ALAS2P22557 587 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CSF2RBP32927 897 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 KDELR2P33947 212 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PCGF2P35227 344 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 OR4D2P58180 307 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CHRNB3Q05901 458 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 STX4Q12846 297 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 RCN1Q15293 331 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 LPAL2Q16609 132 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms