RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423636.6

PTPRN-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRN, Length 3,313 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-204ENST00000423636 NRBF2Q96F24 287 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRN-204ENST00000423636 COX14Q96I36 57 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRN-204ENST00000423636 ACER3Q9NUN7 267 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRN-204ENST00000423636 SCN3BQ9NY72 215 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRN-204ENST00000423636 BTNL2Q9UIR0 455 aa11.3□□□□□ -0.6
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PTPRN-204ENST00000423636 FCRL1Q96LA6 429 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRN-204ENST00000423636 APOL4Q9BPW4 351 aa11.3□□□□□ -0.6
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PTPRN-204ENST00000423636 NUP107P57740 925 aa11.29□□□□□ -0.6
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PTPRN-204ENST00000423636 STX19Q8N4C7 294 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRN-204ENST00000423636 ZNF614Q8N883 585 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRN-204ENST00000423636 ABHD11Q8NFV4 315 aa11.29□□□□□ -0.6
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PTPRN-204ENST00000423636 HYAL2Q12891 473 aa11.29□□□□□ -0.6
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PTPRN-204ENST00000423636 ERICH5Q6P6B1 374 aa11.29□□□□□ -0.6
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PTPRN-204ENST00000423636 Q96MT0 163 aa11.29□□□□□ -0.6
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PTPRN-204ENST00000423636 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
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