RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IKBIPQ70UQ0 350 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BEST3Q8N1M1 668 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC15A4Q8N697 577 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POGLUT1Q8NBL1 392 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR2W6PQ8NHA6 318 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC2A12Q8TD20 617 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAR1Q8WVX9 515 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NCLNQ969V3 563 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM125Q96AQ2 219 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERP27Q96DN0 273 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PGM2Q96G03 612 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZIM3Q96PE6 472 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CFL2Q9Y281 166 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMED5Q9Y3A6 229 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATG4BQ9Y4P1 393 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZGRF1Q86YA3 2104 aa7.99□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A1W2PR48 441 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MASP2O00187 686 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AZIN1O14977 448 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BIRC5O15392 142 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CTIFO43310 598 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TYROBPO43914 113 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCDH7O60245 1069 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR10H2O60403 315 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LDB3O75112 727 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SH3BGRLO75368 114 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZWINTO95229 277 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RASAL1O95294 804 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGKV3-11P04433 115 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP1B1P05026 303 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLK1P06870 262 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CELA2AP08217 269 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FGF4P08620 206 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IFI6P09912 130 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EDN3P14138 238 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PORP16435 677 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCSK2P16519 638 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SSR4P51571 173 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MLLT10P55197 1068 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TUBA3CQ13748 450 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR1C1Q15619 314 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF766Q5HY98 468 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC48A1Q6P1K1 146 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OPN5Q6U736 354 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF175Q8N4F7 328 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM156Q8N614 296 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MDS2Q8NDY4 140 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR7G1Q8NGA0 311 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR4K14Q8NGD5 310 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC22A8Q8TCC7 542 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SCMH1Q96GD3 660 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SGCZQ96LD1 299 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACPTQ9BZG2 426 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM4Q9C037 500 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDCP1Q9H5V8 836 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GIMAP4Q9NUV9 329 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OLAHQ9NV23 265 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRFN1Q9P244 771 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYOTQ9UBF9 498 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa7.98□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A1B0GTL3 188 aa7.97□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa7.97□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ASPDHA6ND91 283 aa7.97□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A8MVJ9 347 aa7.97□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CAPN14A8MX76 684 aa7.97□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC28A1O00337 649 aa7.97□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPP6CO00743 305 aa7.97□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RGS14O43566 566 aa7.97□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NME2P1O60361 137 aa7.97□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ITGA10O75578 1167 aa7.97□□□□□ -1.13
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC25A12O75746 678 aa7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.7 ms