RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 HSD11B2P80365 405 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CHRNB3Q05901 458 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 FOXC1Q12948 553 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SPIDRQ14159 915 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 GRM7Q14831 915 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 FAM214AQ32MH5 1076 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 USP53Q70EK8 1073 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC80Q76M96 950 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ZZZ3Q8IYH5 903 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 D2HGDHQ8N465 521 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 AMER3Q8N944 861 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 OR4K14Q8NGD5 310 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CANT1Q8WVQ1 401 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 NCSTNQ92542 709 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 NCLNQ969V3 563 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 FAM162AQ96A26 154 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SLCO4A1Q96BD0 722 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SLC41A2Q96JW4 573 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF681Q96N22 645 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 AMDHD1Q96NU7 426 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 FCRL4Q96PJ5 515 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 TRIM4Q9C037 500 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 KLHL4Q9C0H6 718 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 VCXQ9H320 206 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CAAP1Q9H8G2 361 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SYNPO2LQ9H987 977 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 IL21RQ9HBE5 538 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 C3orf14Q9HBI5 128 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 FAM60AQ9NP50 221 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 NTMQ9P121 344 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PDP2Q9P2J9 529 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 RIMS3Q9UJD0 308 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 FBXW2Q9UKT8 454 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0G2JN53 185 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PLOD2O00469 737 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PGRMC2O15173 223 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 B4GAT1O43505 415 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CFIP05156 583 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SPINK2P20155 84 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CD1CP29017 333 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 KDELR2P33947 212 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 AVPR1BP47901 424 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ARL4DP49703 201 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 MVDP53602 400 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 OR1D5P58170 312 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PPP1CAP62136 330 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PRR5P85299 388 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 GAB1Q13480 694 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 RUNX2Q13950 521 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 GNA13Q14344 377 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ADRM1Q16186 407 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PRSS53Q2L4Q9 553 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB134Q4QY38 66 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 TBCELQ5QJ74 424 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 WLSQ5T9L3 541 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM71Q6P5X7 295 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 TLDC1Q6P9B6 456 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 FAM92BQ6ZTR7 304 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SPRED1Q7Z699 444 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PTOV1Q86YD1 416 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PACRGLQ8N7B6 248 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ANKFN1Q8N957 763 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 OR56A1Q8NGH5 318 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 MIPOL1Q8TD10 442 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 FIG4Q92562 907 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 GATA6Q92908 595 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 C10orf90Q96M02 699 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 TGM7Q96PF1 710 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 MACROD1Q9BQ69 325 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 BDH2Q9BUT1 245 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 TRIM8Q9BZR9 551 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ZMYND15Q9H091 742 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 GLIPR2Q9H4G4 154 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 GAREM1Q9H706 876 aa9.24□□□□□ -0.93
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