RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 CHIT1Q13231 466 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 KCNAB2Q13303 367 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 NFE2L1Q14494 772 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 KIR2DS5Q14953 304 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SHBQ15464 509 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 MEP1AQ16819 746 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 COL28A1Q2UY09 1125 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPIN4Q56A73 249 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 XKR6Q5GH73 641 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM209AQ5JX71 171 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 GLYATQ6IB77 296 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 LETMD1Q6P1Q0 360 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ENPP7Q6UWV6 458 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 C17orf64Q86WR6 236 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZFAND4Q86XD8 727 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLD3Q8IV08 490 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 VRK3Q8IV63 474 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 POC5Q8NA72 575 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR5K1Q8NHB7 308 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 MCFD2Q8NI22 146 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 NDNFQ8TB73 568 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SH3KBP1Q96B97 665 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SEPHS2Q99611 448 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SH3GL1Q99961 368 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 AIF1LQ9BQI0 150 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 NRSN2Q9GZP1 204 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLA2Q9H6Q3 261 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAGIXQ9H6Y5 334 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 GORASP2Q9H8Y8 452 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRTM1Q9HBL6 345 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 DIABLOQ9NR28 239 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SIRT5Q9NXA8 310 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SCN3BQ9NY72 215 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR6C2Q9NZP2 312 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 MOSPD1Q9UJG1 213 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 AKAP13Q12802 2813 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CACNA1GO43497 2377 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 AGAP5A6NIR3 686 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 METTL15A6NJ78 407 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM25AB3EWG3 89 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM25CB3EWG5 89 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM25GB3EWG6 89 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 RRP8O43159 456 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC22A3O75751 556 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 KCNK2O95069 426 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 DLGAP3O95886 979 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 IL6P05231 212 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 LINC00032P0C843 101 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 GGT1P19440 569 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ETV6P41212 452 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SRP54P61011 504 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 COPZ1P61923 177 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 KEAP1Q14145 624 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 FGL2Q14314 439 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 AP5B1Q2VPB7 878 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF404Q494X3 552 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 RABL3Q5HYI8 236 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 C6orf136Q5SQH8 315 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 LAIR2Q6ISS4 152 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 HIPK1Q86Z02 1210 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 EID3Q8N140 333 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM145Q8NBT3 493 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR8J3Q8NGG0 315 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR2L8Q8NGY9 312 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PSMA8Q8TAA3 256 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF480Q8WV37 535 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 TBC1D20Q96BZ9 403 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CXorf40BQ96DE9 158 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 MED8Q96G25 268 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 C12orf66Q96MD2 445 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 TIMM22Q9Y584 194 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR1A2Q9Y585 309 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRR19A6NJB7 356 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PDZK1P1A8MUH7 402 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 HAT1O14929 419 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms