RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNNI3P19429 210 aa14.28□□□□□ -0.12
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLRB1Q12918 225 aa14.28□□□□□ -0.12
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF32Q9H0A6 362 aa14.28□□□□□ -0.12
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYNNQ9NPC7 610 aa14.28□□□□□ -0.12
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.28□□□□□ -0.12
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.28□□□□□ -0.12
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.28□□□□□ -0.12
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDCP20711 480 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPR143P51810 404 aa14.27□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ID2Q02363 134 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZADH2Q8N4Q0 377 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2T11Q8NH01 316 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.27□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 K7EM74 188 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VPS4BO75351 444 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZFAND5O76080 213 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP1B1P05026 303 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CELA2AP08217 269 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CPMP14384 443 aa14.26□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASMTP46597 345 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XKP51811 444 aa14.26□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 OCRLQ01968 901 aa14.26□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MEP1AQ16819 746 aa14.26□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACER2Q5QJU3 275 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIRT6Q8N6T7 355 aa14.26□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RIT1Q92963 219 aa14.26□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UTS2RQ9UKP6 389 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCM1Q15154 2024 aa14.25□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 A8MUI8 341 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PEX11AO75192 247 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDAH2O95865 285 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGKV3-11P04433 115 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPTBP11277 2137 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRPS2P11908 318 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALDH9A1P49189 494 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEBPEQ15744 281 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSDL2Q6YN16 418 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GALNT12Q8IXK2 581 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
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