RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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CASP4-201ENST00000393150 GRPEL1Q9HAV7 217 aa7.26□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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CASP4-201ENST00000393150 CAPN11Q9UMQ6 739 aa7.26□□□□□ -1.25
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CASP4-201ENST00000393150 CHST10O43529 356 aa7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 TMCC2O75069 709 aa7.25□□□□□ -1.25
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CASP4-201ENST00000393150 SLC16A8O95907 504 aa7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 IL18BPO95998 194 aa7.25□□□□□ -1.25
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CASP4-201ENST00000393150 COL6A2P12110 1019 aa7.25□□□□□ -1.25
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CASP4-201ENST00000393150 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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CASP4-201ENST00000393150 TMEM177Q53S58 311 aa7.25□□□□□ -1.25
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CASP4-201ENST00000393150 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 AMER2Q8N7J2 671 aa7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 ACTL9Q8TC94 416 aa7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 FAR2Q96K12 515 aa7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 PKP4Q99569 1192 aa7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 HAUS8Q9BT25 410 aa7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 CNPPD1Q9BV87 410 aa7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 RHBGQ9H310 441 aa7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 LANCL2Q9NS86 450 aa7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 QPCTLQ9NXS2 382 aa7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 MYOTQ9UBF9 498 aa7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 COPS7AQ9UBW8 275 aa7.25□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.25□□□□□ -1.25
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CASP4-201ENST00000393150 E7ENX8 843 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 G3V3Y1 287 aa7.24□□□□□ -1.25
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CASP4-201ENST00000393150 CEP104O60308 925 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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CASP4-201ENST00000393150 HIST1H2ADP20671 130 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 PSMA3P25788 255 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 FMO4P31512 558 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 HPDP32754 393 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 CCR8P51685 355 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 ATP5J2P56134 94 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 UBASH3AP57075 661 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 ERVFRD-1P60508 538 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 TAP2Q03519 686 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 NR1I3Q14994 352 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 TOMM20Q15388 145 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.24□□□□□ -1.25
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CASP4-201ENST00000393150 LCE3BQ5TA77 95 aa7.24□□□□□ -1.25
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CASP4-201ENST00000393150 PRSS41Q7RTY9 318 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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CASP4-201ENST00000393150 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 KIRREL1Q96J84 757 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 TRIB1Q96RU8 372 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 HIST1H2AJQ99878 128 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 MACROD1Q9BQ69 325 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 H2AFJQ9BTM1 129 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.24□□□□□ -1.25
CASP4-201ENST00000393150 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.24□□□□□ -1.25
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