RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 GPX3P22352 226 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 GSTM4Q03013 218 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 KLHL26Q53HC5 615 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 MANEALQ5VSG8 457 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 USP53Q70EK8 1073 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SUN3Q8TAQ9 357 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM125Q96AQ2 219 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 HSPA12BQ96MM6 686 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 TGM7Q96PF1 710 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 BEX2Q9BXY8 128 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 BEX1Q9HBH7 125 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 LAMB4A4D0S4 1761 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 CA3P07451 260 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 JUNDP17535 347 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF550Q7Z398 422 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC5A8Q8N695 610 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SHKBP1Q8TBC3 707 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 NSMAFQ92636 917 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 H0YJX3 145 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC1A7O00341 560 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 HTR1AP08908 422 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 OR6N2Q8NGY6 317 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 FUZQ9BT04 418 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 UBR2Q8IWV8 1755 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PPK0 400 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 PFKLP17858 780 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 C5AR1P21730 350 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 HOXC12P31275 282 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 STT3AP46977 705 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 CLCN2P51788 898 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 PUDPQ08623 228 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SPHARQ15513 63 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 TAZQ16635 292 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM164Q5U3C3 297 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 OR52N2Q8NGI0 321 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 EBF1Q9UH73 591 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 LAMP5Q9UJQ1 280 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 RCAN2Q14206 197 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 AAK1Q2M2I8 961 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SYCE2Q6PIF2 218 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC36Q8IYA8 594 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SCML4Q8N228 414 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 NEIL3Q8TAT5 605 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ECHDC3Q96DC8 303 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SAMD11Q96NU1 681 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 PRODH2Q9UF12 536 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 MAFFQ9ULX9 164 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 C5orf51A6NDU8 294 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 UGT3A2Q3SY77 523 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM35AQ53FP2 167 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 GRHL2Q6ISB3 625 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF534Q76KX8 674 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 MAGIXQ9H6Y5 334 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 POLE4Q9NR33 117 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ENAMQ9NRM1 1142 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 OR5K4A6NMS3 321 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF13O43567 381 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 PLGP00747 810 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 PYCR1P32322 319 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 AKR1D1P51857 326 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF234Q14588 700 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 UNC5DQ6UXZ4 953 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 RBP7Q96R05 134 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 CMAHPQ9Y471 501 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ATF6P18850 670 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 TAS2R38P59533 333 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 TCEAL4Q96EI5 215 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SPATA9Q9BWV2 254 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAPPC6AO75865 159 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 TIMP1P01033 207 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 RNH1P13489 461 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SDC1P18827 310 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 DCTP40126 519 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SUOXP51687 545 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 HK3P52790 923 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 CLCA4Q14CN2 919 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 OR52E8Q6IFG1 317 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 HS3ST5Q8IZT8 346 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFAND2BQ8WV99 257 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 FOXJ1Q92949 421 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM210AQ96ND0 272 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ATOH8Q96SQ7 321 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF121Q9H920 327 aa16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms