RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390435.1

TRAV8-3-201, Transcript of T cell receptor alpha variable 8-3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRAV8-3, Length 341 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV8-3-201ENST00000390435 F8A1P23610 371 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 S100A3P33764 101 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 FEN1P39748 380 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 KIR3DL1P43629 444 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 STT3AP46977 705 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 PGDP52209 483 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 SEC24CP53992 1094 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 DIO3P55073 304 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 MANFP55145 182 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 NME5P56597 212 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 ID2Q02363 134 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 PTGR1Q14914 329 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 TERF2Q15554 542 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 SFT2D3Q587I9 215 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 NDUFAF7Q7L592 441 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 SZRD1Q7Z422 152 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 ANKRD37Q7Z713 158 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 MRGPREQ86SM8 312 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 TRIML2Q8N7C3 387 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 RIT1Q92963 219 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 TSLPQ969D9 159 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 MARK4Q96L34 752 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 EBF4Q9BQW3 602 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 DUSP26Q9BV47 211 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 BRINP2Q9C0B6 783 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 C3orf14Q9HBI5 128 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 ABI3Q9P2A4 366 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 IL17BQ9UHF5 180 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 ATP6V1HQ9UI12 483 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 CFL2Q9Y281 166 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAV8-3-201ENST00000390435 A0A1W2PRB8 838 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 DYTNA2CJ06 578 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 CCDC154A6NI56 674 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 A8MUA0 341 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 C17orf105B2RV13 164 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 ZNF195O14628 629 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 PGRMC2O15173 223 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 EFSO43281 561 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 SNX3O60493 162 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 COQ9O75208 318 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 ANP32DO95626 131 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 FAM107AO95990 144 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 UMODP07911 640 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 DRD4P21917 467 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 TACR1P25103 407 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 GALNSP34059 522 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 SOAT1P35610 550 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 C21orf58P58505 322 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 CXADRP78310 365 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 BTG2P78543 158 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 VAC14Q08AM6 782 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 ATP1A4Q13733 1029 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 BTBD16Q32M84 506 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 MMEL1Q495T6 779 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 SPDYE7PQ495Y7 208 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 TMEM198Q66K66 360 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 TMEM205Q6UW68 189 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 SLC29A4Q7RTT9 530 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 MAVSQ7Z434 540 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 CCDC197Q8NCU1 140 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 MORN4Q8NDC4 146 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 BCAS4Q8TDM0 211 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 C10orf82Q8WW14 230 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 TESCQ96BS2 214 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 C8orf44Q96CB5 159 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 VMP1Q96GC9 406 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 EGLN2Q96KS0 407 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 CNPPD1Q9BV87 410 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms