RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 ZMYND11Q15326 602 aa16.01■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 COL28A1Q2UY09 1125 aa16.01■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 BCL2L15Q5TBC7 163 aa16.01■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 MEDAGQ5VYS4 303 aa16.01■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 LIPIQ6XZB0 460 aa16.01■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 C11orf65Q8NCR3 313 aa16.01■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.01■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 RHCGQ9UBD6 479 aa16.01■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 LAMP1P11279 417 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 RGNQ15493 299 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 ADGRG3Q86Y34 549 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 OR11H7Q8NGC8 314 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 UCN3Q969E3 161 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 SORCS2Q96PQ0 1159 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 FOLH1BQ9HBA9 442 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 SOX14O95416 240 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 C1SP09871 688 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 AMD1P17707 334 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 RPS25P62851 125 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 RBBP4Q09028 425 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 NOGQ13253 232 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 GAB1Q13480 694 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 NCF4Q15080 339 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 SPDYE7PQ495Y7 208 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 MPPE1Q53F39 396 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 CLDN19Q8N6F1 224 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 CEP76Q8TAP6 659 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 WFDC5Q8TCV5 224 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 UBTD2Q8WUN7 234 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 BOCQ9BWV1 1114 aa16■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 A8MVJ9 347 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 IFNA7P01567 189 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 PSMA3P25788 255 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 GKP32189 559 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 ETV1P50549 477 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 STK40Q8N2I9 435 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 OR10Z1Q8NGY1 313 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 MARC2Q969Z3 335 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 PLD4Q96BZ4 506 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 TSSK6Q9BXA6 273 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 ADGRE3Q9BY15 652 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 LATS2Q9NRM7 1088 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 ENOPH1Q9UHY7 261 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 GADD45GO95257 159 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 MPC2O95563 127 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 HK1P19367 917 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 AVPR1BP47901 424 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 ZNF81P51508 661 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 RHOAP61586 193 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 ATAT1Q5SQI0 421 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 TMEM107Q6UX40 140 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 CRIPAKQ8N1N5 446 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 EID2BQ96D98 161 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 CREBZFQ9NS37 354 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 UBQLN2Q9UHD9 624 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 IFNA16P05015 189 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 CTBP2P56545 445 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 BICRALQ6AI39 1079 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 TMEM163Q8TC26 289 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 TM9SF4Q92544 642 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 TMEM175Q9BSA9 504 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 MED18Q9BUE0 208 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 GPR63Q9BZJ6 419 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 RDH8Q9NYR8 311 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 YIPF1Q9Y548 306 aa15.99■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa15.98■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 SGK494L7N484 410 aa15.98■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 NNMTP40261 264 aa15.98■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 SEMG2Q02383 582 aa15.98■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 TEAD4Q15561 434 aa15.98■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 CFAP77Q6ZQR2 320 aa15.98■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa15.98■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 ST8SIA4Q92187 359 aa15.98■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 KLHL15Q96M94 604 aa15.98■□□□□ 0.15
GDE1-201ENST00000353258 RBP7Q96R05 134 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms