RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 GINS1Q14691 196 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 BTBD16Q32M84 506 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SLC27A4Q6P1M0 643 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ERMP1Q7Z2K6 904 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SHKBP1Q8TBC3 707 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 NXPE3Q969Y0 559 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MROQ9BYG7 248 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 HEBP1Q9NRV9 189 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 FAAHO00519 579 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PRAMEF2O60811 474 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CDKN2DP55273 166 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 OR2T33Q8NG76 320 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 STRA6Q9BX79 667 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 C5orf51A6NDU8 294 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 OR1E2P47887 323 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF33BQ06732 778 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ECH1Q13011 328 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 GRIN2CQ14957 1233 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 OR51A7Q8NH64 312 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TCEAL4Q96EI5 215 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SGTBQ96EQ0 304 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 DOHHQ9BU89 302 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ODF4Q2M2E3 257 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PLCZ1Q86YW0 608 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SLC5A8Q8N695 610 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 OR14L1PQ8NHC6 308 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MAP3K3Q99759 626 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CSN2P05814 226 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 DCKP27707 260 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ENTPD1P49961 510 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 FAM174AQ8TBP5 190 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 BOCQ9BWV1 1114 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 NANSQ9NR45 359 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 OR14I1A6ND48 311 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 A6NLC8 198 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 BRINP1O60477 761 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 GGT2P36268 569 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CLDN8P56748 225 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 RPL19P84098 196 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM80Q96HE8 168 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MKS1Q9NXB0 559 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 GJD2Q9UKL4 321 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 A0A0J9YY10 115 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 FTCDNL1E5RQL4 147 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SDHDO14521 159 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PRH1P02810 166 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 GSTM2P28161 218 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 KDELR2P33947 212 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MALLQ13021 153 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TDGQ13569 410 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 ZFP69Q49AA0 526 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CDKL4Q5MAI5 379 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 FIGNL1Q6PIW4 674 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 RLN3Q8WXF3 142 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 SERINC2Q96SA4 455 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 TMED9Q9BVK6 235 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 DRGXA6NNA5 263 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PRAMEF10O60809 474 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 PEPDP12955 493 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 GJA4P35212 333 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 MFSD13AQ14CX5 517 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 C4orf46Q504U0 113 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CEP76Q8TAP6 659 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 AIG1Q9NVV5 245 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 NUAK1O60285 661 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CLDN2P57739 230 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 CLCA4Q14CN2 919 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 GLT8D1Q68CQ7 371 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRO-202ENST00000348962 B3GNT9Q6UX72 402 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 155.4 ms