RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344376.9

ATG4B-201, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-201ENST00000344376 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 L3HYPDHQ96EM0 354 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 FBXL20Q96IG2 436 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 A0A1B0GTL3 188 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 A0A1W2PPM1 405 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CDH16O75309 829 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 HSD3B1P14060 373 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 HSD3B2P26439 372 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PIK3R1P27986 724 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 HK2P52789 917 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PKNOX1P55347 436 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 NAA20P61599 178 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CCDC153Q494R4 210 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 COMMD6Q7Z4G1 85 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF227Q86WZ6 799 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF321PQ8N8H1 164 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF721Q8TF20 911 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 RIT1Q92963 219 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MAGED4Q96JG8 741 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 GPR137Q96N19 417 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 RASL10BQ96S79 203 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CNPPD1Q9BV87 410 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 WIPF3A6NGB9 483 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 TMEM200CA6NKL6 621 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 NPIPA5E9PKD4 350 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MANBAO00462 879 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ULK1O75385 1050 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ENO1P06733 434 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SLC35E2P0CK97 266 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 RNF224P0DH78 156 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 GALNSP34059 522 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MEOX1P50221 254 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 OPN5Q6U736 354 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ZYG11AQ6WRX3 759 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CCNYL1Q8N7R7 359 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 NUBPLQ8TB37 319 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 METTL6Q8TCB7 284 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF225Q9UK10 706 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 GRID1Q9ULK0 1009 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 POLEQ07864 2286 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 A1L4Q6 167 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 COPEO14579 308 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PEX1O43933 1283 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 OR6B1O95007 311 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 IGKV3-11P04433 115 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SOX3P41225 446 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ERVK-8P63133 956 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 IL20RBQ6UXL0 311 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 FJX1Q86VR8 437 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SULF2Q8IWU5 870 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CCDC63Q8NA47 563 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PSD4Q8NDX1 1056 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MID2Q9UJV3 735 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 EMCNQ9ULC0 261 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ERVK-19Q9WJR5 959 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 C1orf226A1L170 272 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 TFECO14948 347 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SLC19A2O60779 497 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CRHR1P34998 444 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MPEG1Q2M385 716 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CFAP157Q5JU67 520 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MTFR2Q6P444 385 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 RTL4Q6ZR62 310 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MDGA2Q7Z553 956 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SIAH3Q8IW03 269 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 GALNT12Q8IXK2 581 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 GHDCQ8N2G8 530 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 RDH11Q8TC12 318 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms