RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339365.2

SEC24C-201, Transcript of SEC24 homolog C, COPII coat complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SEC24C, Length 4,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24C-201ENST00000339365 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 ACADVLP49748 655 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 CTBP2P56545 445 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 GPR19Q15760 415 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 RAET1LQ5VY80 246 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 PMS2CLQ68D20 193 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 VRK3Q8IV63 474 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 CDRT4Q8N9R6 151 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 BIRC8Q96P09 236 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 P2RY12Q9H244 342 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 IKZF3Q9UKT9 509 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 U3KQV3 271 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 SEC16AO15027 2179 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 TRPM6Q9BX84 2022 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 TTC28Q96AY4 2481 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 PEX11BO96011 259 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF28P17035 718 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 SERPINB10P48595 397 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 CDH12P55289 794 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 ZXDBP98169 803 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 SLC34A1Q06495 639 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 RBBP4Q09028 425 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 OR9I1Q8NGQ6 314 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 RELTQ969Z4 430 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 FAM122AQ96E09 287 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 UBXN10Q96LJ8 280 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 AIG1Q9NVV5 245 aa10.27□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 SERPINA1P01009 418 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 FCARP24071 287 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 RAB38P57729 211 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF440Q8IYI8 595 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 OR7A2PQ8NGA2 310 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 OR4C6Q8NH72 309 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 GRHL3Q8TE85 626 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 NXPE2Q96DL1 559 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 SLITRK2Q9H156 845 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 ADAM29Q9UKF5 820 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 ECHS1P30084 290 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 YAP1P46937 504 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 ST3GAL3Q11203 375 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 BNIPLQ7Z465 357 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 SFTPA1Q8IWL2 248 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 UBE2J2Q8N2K1 259 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 NFKBIDQ8NI38 313 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 NR4A3Q92570 626 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 ACAD8Q9UKU7 415 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 GABRB3P28472 473 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 EFR3AQ14156 821 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 CLCA4Q14CN2 919 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 ZSWIM7Q19AV6 140 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 ZSWIM9Q86XI8 627 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 SVOPQ8N4V2 548 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 OR6N1Q8NGY5 312 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 OR52J3Q8NH60 311 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 OR14A16Q8NHC5 309 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 APIPQ96GX9 242 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 DOHHQ9BU89 302 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 ERVK-19Q9WJR5 959 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 MMACHCQ9Y4U1 282 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 GFRA3O60609 400 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 CCNB2O95067 398 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 MFN2O95140 757 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 OR12D1P0DN82 309 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF423Q2M1K9 1284 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 KANK2Q63ZY3 851 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 GATSQ8NAP1 163 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 DOK4Q8TEW6 326 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 WDR60Q8WVS4 1066 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 SPHK1Q9NYA1 384 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 SLC23A2Q9UGH3 650 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 TESMINQ9Y4I5 508 aa10.26□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 A0A096LPI6 279 aa10.25□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 A0A1B0GTQ1 180 aa10.25□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 A0A1W2PQF6 199 aa10.25□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 IL33O95760 270 aa10.25□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 HSMCR30P0CW71 290 aa10.25□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF823P16415 610 aa10.25□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 DDCP20711 480 aa10.25□□□□□ -0.77
SEC24C-201ENST00000339365 TRIM23P36406 574 aa10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms