RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313352.11

PUF60-201, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PUF60, Length 1,804 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-201ENST00000313352 CROCCP2Q86T23 111 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ZNF721Q8TF20 911 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 C16orf78Q8WTQ4 265 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 TWIST2Q8WVJ9 160 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 PNPLA2Q96AD5 504 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 DGAT2Q96PD7 388 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 NMRK1Q9NWW6 199 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 MCM8Q9UJA3 840 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 TTLL8A6PVC2 850 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 PIP5K1BO14986 540 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 SASH3O75995 380 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ZWINTO95229 277 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 TACR1P25103 407 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 SOX18P35713 384 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ASPHQ12797 758 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 SERTAD2Q14140 314 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 TTMPQ5BVD1 217 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ZNF781Q8N8C0 355 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 SIMC1Q8NDZ2 872 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 CDC26Q8NHZ8 85 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 EGLN2Q96KS0 407 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 HES7Q9BYE0 225 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 NTNG1Q9Y2I2 539 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ATP6AP2O75787 350 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 FEN1P39748 380 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 CLCN2P51788 898 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 TERF2Q15554 542 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 SPIN4Q56A73 249 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 OR52E8Q6IFG1 317 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 SLC48A1Q6P1K1 146 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 CLYBLQ8N0X4 340 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 HAS2Q92819 552 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 SORT1Q99523 831 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 DEFB126Q9BYW3 111 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 WDR41Q9HAD4 459 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 SLAMF7Q9NQ25 335 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 BLACEA4D250 179 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 H3BQF6 201 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 BIRC5O15392 142 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 SEC22BO75396 215 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 CLPSP04118 112 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 SERPINE1P05121 402 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 CD96P40200 585 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 TNFSF10P50591 281 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 XKP51811 444 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ERVK-8P63133 956 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 SPINK14Q6IE38 97 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 GALNT18Q6P9A2 607 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 DDIASQ8IXT1 998 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 OR4K14Q8NGD5 310 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 OR1N1Q8NGS0 311 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 VMP1Q96GC9 406 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 PPP1R36Q96LQ0 422 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ZNF354BQ96LW1 612 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 CNPPD1Q9BV87 410 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ERVK-19Q9WJR5 959 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 C1orf226A1L170 272 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 GOLGA6L10A6NI86 522 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 GABRR3A8MPY1 467 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 OR10H2O60403 315 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 IGKV3-11P04433 115 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 PIK3R1P27986 724 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 SSTR4P31391 388 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 MLF1P58340 268 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 PLIN5Q00G26 463 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 TUBA3CQ13748 450 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 NR6A1Q15406 480 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 MEP1AQ16819 746 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 GALNTL6Q49A17 601 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 NOXRED1Q6NXP6 359 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 TUBA3EQ6PEY2 450 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ZNF227Q86WZ6 799 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 SLC5A8Q8N695 610 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 ADCY4Q8NFM4 1077 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 OR14A16Q8NHC5 309 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-201ENST00000313352 TM9SF4Q92544 642 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms