RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 ARMC6Q6NXE6 501 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ARL10Q8N8L6 244 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 OR5D16Q8NGK9 328 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM19Q96HH6 336 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SERINC2Q96SA4 455 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 POMT2Q9UKY4 750 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SCN3AQ9NY46 2000 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEF25A6NGN4 478 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ST6GAL1P15907 406 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 IFI44LQ53G44 452 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM107Q6UX40 140 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 PRSS41Q7RTY9 318 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 GKN2Q86XP6 184 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SHISA5Q8N114 240 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf216Q8TAB5 229 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SLC35G5Q96KT7 338 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF681Q96N22 645 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 RDH12Q96NR8 316 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 MUS81Q96NY9 551 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ROGDIQ9GZN7 287 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 FAM60AQ9NP50 221 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFAF4Q9P032 175 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 THEGQ9P2T0 379 aa21.48■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF860A6NHJ4 632 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 C5orf58C9J3I9 102 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 CLPTM1O96005 669 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 OR12D1P0DN82 309 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 CPN2P22792 545 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 LIM2P55344 173 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 TNFRSF17Q02223 184 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ABHD13Q7L211 337 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SLC30A8Q8IWU4 369 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF786Q8N393 782 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 LZICQ8WZA0 190 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 C10orf90Q96M02 699 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 CSF3RQ99062 836 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 OR51I1Q9H343 314 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 REEP1Q9H902 201 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SEMA3GQ9NS98 782 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 STARD5Q9NSY2 213 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 UBXN7O94888 489 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 TFAP2AP05549 437 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 FPR1P21462 350 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 PIGAP37287 484 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGDIAP52565 204 aa21.47■■□□□ 1.03
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VSTM4-201ENST00000298454 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 OR9A2Q8NGT5 310 aa21.47■■□□□ 1.03
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VSTM4-201ENST00000298454 RUBCNLQ9H714 662 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 FAM118AQ9NWS6 357 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 DAPP1Q9UN19 280 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa21.47■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 COL6A3P12111 3177 aa21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 K7ESF4 209 aa21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 VILLO15195 856 aa21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 B3GALT2O43825 422 aa21.46■■□□□ 1.03
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VSTM4-201ENST00000298454 ALOX12P18054 663 aa21.46■■□□□ 1.03
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VSTM4-201ENST00000298454 MPIP34949 423 aa21.46■■□□□ 1.03
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VSTM4-201ENST00000298454 GIMAP4Q9NUV9 329 aa21.46■■□□□ 1.03
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VSTM4-201ENST00000298454 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 MITFO75030 526 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 CTSBP07858 339 aa21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 RRM2P31350 389 aa21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 FASLGP48023 281 aa21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 KCNAB2Q13303 367 aa21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 DUSP7Q16829 419 aa21.46■■□□□ 1.03
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