RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 APIPQ96GX9 242 aa23.4■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa23.4■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 CNPPD1Q9BV87 410 aa23.4■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 FAIM2Q9BWQ8 316 aa23.4■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 CLMPQ9H6B4 373 aa23.4■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 NTNG1Q9Y2I2 539 aa23.4■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa23.4■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 FASNP49327 2511 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PDF-201ENST00000288022 C1orf226A1L170 272 aa23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 SERTM1A2A2V5 107 aa23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 NPHS1O60500 1241 aa23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 ALDH9A1P49189 494 aa23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 ZNF766Q5HY98 468 aa23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 SPINK14Q6IE38 97 aa23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 FAM180AQ6UWF9 173 aa23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 GALNT11Q8NCW6 608 aa23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 GRHL3Q8TE85 626 aa23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 RIT1Q92963 219 aa23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 ART5Q96L15 291 aa23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 C5orf34Q96MH7 638 aa23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 LRFN1Q9P244 771 aa23.39■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 AZIN1O14977 448 aa23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 ITGA10O75578 1167 aa23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 BPGMP07738 259 aa23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 SLC35E2P0CK97 266 aa23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 CD46P15529 392 aa23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 CYB561P49447 251 aa23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 MMP21Q8N119 569 aa23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 ARMC10Q8N2F6 343 aa23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 TMEM156Q8N614 296 aa23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 MDS2Q8NDY4 140 aa23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 ZNF721Q8TF20 911 aa23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 PGM2Q96G03 612 aa23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 EBPLQ9BY08 206 aa23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 KLHL1Q9NR64 748 aa23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 A0A1W2PS29 197 aa23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 CHEK2O96017 543 aa23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 CHRNGP07510 517 aa23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 XKP51811 444 aa23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 ERVK-8P63133 956 aa23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 RAE1P78406 368 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 INAQ16352 499 aa23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 SLC48A1Q6P1K1 146 aa23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 TRIM46Q7Z4K8 759 aa23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 FBXL20Q96IG2 436 aa23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 KCNK9Q9NPC2 374 aa23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 PSME2Q9UL46 239 aa23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 ERVK-19Q9WJR5 959 aa23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa23.37■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 GOLGA6L10A6NI86 522 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 TCP11X1B4DZS4 312 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 HRKO00198 91 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 WWP2O00308 870 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 CDK2AP1O14519 115 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 RASAL1O95294 804 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 IL3P08700 152 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 GNLYP22749 145 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 ETV4P43268 484 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 HLCSP50747 726 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 SSR4P51571 173 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 RNF4P78317 190 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 NR6A1Q15406 480 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 C6orf163Q5TEZ5 329 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 NUDCD3Q8IVD9 361 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 OR5L2Q8NGL0 311 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 OR8K3Q8NH51 312 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 CDC26Q8NHZ8 85 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 KLHL29Q96CT2 875 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 HES7Q9BYE0 225 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 MYOTQ9UBF9 498 aa23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 WDR91A4D1P6 747 aa23.35■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 SLC28A1O00337 649 aa23.35■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 OR2J2O76002 312 aa23.35■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 CPMP14384 443 aa23.35■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 PORP16435 677 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PDF-201ENST00000288022 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms