RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 GZMMP51124 257 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ILKQ13418 452 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PYCR3Q53H96 274 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 FAM219BQ5XKK7 198 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC27A4Q6P1M0 643 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 XKRXQ6PP77 449 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC9B2Q86UD5 537 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PINK1Q9BXM7 581 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ANHXE9PGG2 379 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 AQP9O43315 295 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ENTPD6O75354 484 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 YES1P07947 543 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC35G6P0C7Q6 338 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 OR12D1P0DN82 309 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 B4GALNT1Q00973 533 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GID4Q8IVV7 300 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ING5Q8WYH8 240 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 EID2BQ96D98 161 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NEURL3Q96EH8 262 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CCDC3Q9BQI4 270 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CDCA4Q9BXL8 241 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 VNN3Q9NY84 501 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 KRT87PA6NCN2 255 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DHFRP00374 187 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SERPINA3P01011 423 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ADRB3P13945 408 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 STAT5AP42229 794 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CLCNKAP51800 687 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CDKN3Q16667 212 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PARP16Q8N5Y8 322 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PROKR2Q8NFJ6 384 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 FCRL4Q96PJ5 515 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLITRK2Q9H156 845 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 OR51E2Q9H255 320 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 POLE4Q9NR33 117 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RIIAD1A6NNX1 92 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ERI3O43414 337 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 B3GALT2O43825 422 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SOX14O95416 240 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DNTTP04053 509 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SCG5P05408 212 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PRG2P13727 222 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 IDUAP35475 653 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CDH11P55287 796 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TAS2R38P59533 333 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DMPKQ09013 629 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GBX1Q14549 363 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RFLNAQ6ZTI6 216 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NRROSQ86YC3 692 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 LRRC17Q8N6Y2 441 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RAB8BQ92930 207 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 F2RL3Q96RI0 385 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NELL2Q99435 816 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TMEM184CQ9NVA4 438 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PLAGL1Q9UM63 463 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CLEC3AO75596 197 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 IGHA2P01877 340 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC9A3P48764 834 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TAS2R43P59537 309 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 MXD1Q05195 221 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GATAD2AQ86YP4 633 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RNF175Q8N4F7 328 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CHFRQ96EP1 664 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TXNDC15Q96J42 360 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 BTBD2Q9BX70 525 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RMI1Q9H9A7 625 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 MARK1Q9P0L2 795 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TMEM5Q9Y2B1 443 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PCDH17O14917 1159 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CYP7B1O75881 506 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RCBTB2O95199 551 aa8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms