RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.06
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HOXD9-201ENST00000249499 CERS1P27544 350 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD9-201ENST00000249499 OR1E2P47887 323 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD9-201ENST00000249499 LIMS1P48059 325 aa21.63■■□□□ 1.05
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HOXD9-201ENST00000249499 SUN3Q8TAQ9 357 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD9-201ENST00000249499 PROX1Q92786 737 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD9-201ENST00000249499 SMIM10Q96HG1 83 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD9-201ENST00000249499 OR2A5Q96R48 311 aa21.62■■□□□ 1.05
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HOXD9-201ENST00000249499 SERHL2Q9H4I8 314 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD9-201ENST00000249499 SYNPO2LQ9H987 977 aa21.62■■□□□ 1.05
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