RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 CROCCQ5TZA2 2017 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 C1orf226A1L170 272 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA6L10A6NI86 522 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SLC28A1O00337 649 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SASH3O75995 380 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 IGKV3-11P04433 115 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SLC35E2P0CK97 266 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SOX18P35713 384 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 CLCN2P51788 898 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R50P59544 299 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 IMPG1Q17R60 797 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 TTMPQ5BVD1 217 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 HDXQ7Z353 690 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 C7orf57Q8NEG2 295 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 AGR3Q8TD06 166 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SLC2A12Q8TD20 617 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 TWIST2Q8WVJ9 160 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 VMP1Q96GC9 406 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 FCRL1Q96LA6 429 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ZNF354BQ96LW1 612 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 RNF32Q9H0A6 362 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 CDCP1Q9H5V8 836 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 LUZP4Q9P127 313 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa20.76■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 TMEM114B3SHH9 223 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 PIP5K1BO14986 540 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 GUCY1B2O75343 617 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 F10P00742 488 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 IL3P08700 152 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 TNNI3P19429 210 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 DUSP2Q05923 314 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 MEP1AQ16819 746 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 PRSS53Q2L4Q9 553 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ABHD17BQ5VST6 288 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 NOXRED1Q6NXP6 359 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ZNF605Q86T29 641 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 BEST3Q8N1M1 668 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 OR4K14Q8NGD5 310 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 OR1N1Q8NGS0 311 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 C3orf30Q96M34 536 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ZNF681Q96N22 645 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 DGAT2Q96PD7 388 aa20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 LSM1O15116 133 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 CLPSP04118 112 aa20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 GALNSP34059 522 aa20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 TNFSF10P50591 281 aa20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 XKP51811 444 aa20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 MLF1P58340 268 aa20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 XKR7Q5GH72 579 aa20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 LGI4Q8N135 537 aa20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SLC5A8Q8N695 610 aa20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ZNF781Q8N8C0 355 aa20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 DEFB126Q9BYW3 111 aa20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 OR8D2Q9GZM6 311 aa20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 C1orf109Q9NX04 203 aa20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 HAO1Q9UJM8 370 aa20.74■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 FASNP49327 2511 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 RGS14O43566 566 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SLC28A2O43868 658 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 JUNP05412 331 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 CT62P0C5K7 136 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 CPMP14384 443 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 DRD2P14416 443 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 GRK2P25098 689 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 TACR1P25103 407 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 PIK3R1P27986 724 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SLC1A6P48664 564 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 PLIN5Q00G26 463 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 BST1Q10588 318 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SPRED3Q2MJR0 410 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 HHATQ5VTY9 493 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 FAM71E1Q6IPT2 247 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 FAM180BQ6P0A1 224 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 MGARPQ8TDB4 240 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 LRTM1Q9HBL6 345 aa20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms