RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD28O15084 1053 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 FGF17O60258 216 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PRMT3O60678 531 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC22O60826 627 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CTNSO60931 367 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 HEXBP07686 556 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CD63P08962 238 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 COX7A2P14406 83 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PRPS1L1P21108 318 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 GPX3P22352 226 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 F8A1P23610 371 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PIK3R1P27986 724 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PTPN4P29074 926 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PPP2R1BP30154 601 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 RPL3P39023 403 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ATP4BP51164 291 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 HSD17B7P56937 341 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 RHAGQ02094 409 aa8□□□□□ -1.13
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SGMS1-211ENST00000626236 STX4Q12846 297 aa8□□□□□ -1.13
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SGMS1-211ENST00000626236 PGS1Q32NB8 556 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 FAAH2Q6GMR7 532 aa8□□□□□ -1.13
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SGMS1-211ENST00000626236 SLC48A1Q6P1K1 146 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PAOXQ6QHF9 649 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 QSOX2Q6ZRP7 698 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
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SGMS1-211ENST00000626236 VASH2Q86V25 355 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 TICAM1Q8IUC6 712 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM151BQ8IW70 566 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 OR4N5Q8IXE1 308 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC197Q8NCU1 140 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 OR7A2PQ8NGA2 310 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 OR4K14Q8NGD5 310 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 OR9I1Q8NGQ6 314 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 OR2Y1Q8NGV0 311 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 DNAJB14Q8TBM8 379 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 TANKQ92844 425 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 FGF11Q92914 225 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 TSLPQ969D9 159 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PPCDCQ96CD2 204 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 MTERF3Q96E29 417 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 TEX37Q96LM6 180 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PTCHD1Q96NR3 888 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CRB3Q9BUF7 120 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 GPR87Q9BY21 358 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 VN1R1Q9GZP7 353 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 NMUR2Q9GZQ4 415 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ACTL8Q9H568 366 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF385DQ9H6B1 395 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
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SGMS1-211ENST00000626236 NECTIN3Q9NQS3 549 aa8□□□□□ -1.13
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SGMS1-211ENST00000626236 ZIM2Q9NZV7 527 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC167Q9P0B6 97 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 SH3BP4Q9P0V3 963 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 C3orf18Q9UK00 162 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CES1P1Q9UKY3 287 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PSME2Q9UL46 239 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 TCFL5Q9UL49 500 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 MAPRE3Q9UPY8 281 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 MMACHCQ9Y4U1 282 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 KNTC1P50748 2209 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PS29 197 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 GABRR3A8MPY1 467 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 FCHO1O14526 889 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ALOX12BO75342 701 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 DCTN3O75935 186 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 GPR75O95800 540 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 C8orf89P0DMQ9 161 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 LAMP1P11279 417 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 LIFP15018 202 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PCSK2P16519 638 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 DDX5P17844 614 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 IL12AP29459 219 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 FEN1P39748 380 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 EFNA3P52797 238 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 EMP2P54851 167 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 C21orf58P58505 322 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CLN3Q13286 438 aa7.99□□□□□ -1.13
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