RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99-211ENST00000623253 ZNF721Q8TF20 911 aa14.93□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 LRRC46Q96FV0 321 aa14.93□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 KCNC2Q96PR1 638 aa14.93□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.93□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.93□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 LYRM4Q9HD34 91 aa14.93□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 A6NNC1 897 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 SYT5O00445 386 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 DVL2O14641 736 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 TAPBPO15533 448 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 DYRK3O43781 588 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 PRAMEF4O60810 478 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 CPN2P22792 545 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 PEX19P40855 299 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 MSH2P43246 934 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 TGFBIQ15582 683 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 MPEG1Q2M385 716 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 DOK4Q8TEW6 326 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 DGAT2Q96PD7 388 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 KRT12Q99456 494 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 TMEM79Q9BSE2 394 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 EHD1Q9H4M9 534 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 ZFP64Q9NPA5 681 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 RNF14Q9UBS8 474 aa14.92□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 STK16O75716 305 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 LRATO95237 230 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 PCNAP12004 261 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 WNT3P56703 355 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 IRF8Q02556 426 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 PDK4Q16654 411 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 FLYWCH1Q4VC44 716 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 GPSM1Q86YR5 675 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 NUBPLQ8TB37 319 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 FAM222BQ8WU58 562 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP14.91□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 DNAJC13O75165 2243 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 HRKO00198 91 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 FGF17O60258 216 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 FAM155BO75949 473 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 TGFB1P01137 390 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 CD22P20273 847 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 SSR2P43308 183 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 STT3AP46977 705 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 ASCL1P50553 236 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 ADAM8P78325 824 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 CHIT1Q13231 466 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 LAPTM5Q13571 262 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 SEM1Q6ZVN7 128 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 NAXEQ8NCW5 288 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 BBOF1Q8ND07 529 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 FBXO36Q8NEA4 188 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 TNIP2Q8NFZ5 429 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 OR10G3Q8NGC4 313 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 PAQR8Q8TEZ7 354 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 DERL2Q9GZP9 239 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 CD274Q9NZQ7 290 aa14.9□□□□□ -0.02
CD99-211ENST00000623253 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms