RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 ADAM29Q9UKF5 820 aa25.12■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 A0A1B0GTL3 188 aa25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 TMPRSS11DO60235 418 aa25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 ULK1O75385 1050 aa25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 PROCP04070 461 aa25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 FOLH1Q04609 750 aa25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 SPINK14Q6IE38 97 aa25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 HSDL2Q6YN16 418 aa25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 TMEM156Q8N614 296 aa25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 ART5Q96L15 291 aa25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 KLHL1Q9NR64 748 aa25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 EMCNQ9ULC0 261 aa25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 ASB4Q9Y574 426 aa25.11■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 SHANK1Q9Y566 2161 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 MANBAO00462 879 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 OR10H2O60403 315 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 PLIN3O60664 434 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 CRCPO75575 148 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 CBX6O95503 412 aa25.1■■□□□ 1.61
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BRD4-208ENST00000597315 HSD3B2P26439 372 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 STT3AP46977 705 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 MAPK12P53778 367 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 SH2D5Q6ZV89 423 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 METTL4Q8N3J2 472 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 DNAJB8Q8NHS0 232 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 CAVIN3Q969G5 261 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 MID1IP1Q9NPA3 183 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 ZNF225Q9UK10 706 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa25.1■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 A0A1W2PR48 441 aa25.09■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 GLOD5A6NK44 160 aa25.09■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 G3V2L1 256 aa25.09■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
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BRD4-208ENST00000597315 GPR75O95800 540 aa25.09■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 AIFM1O95831 613 aa25.09■■□□□ 1.61
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BRD4-208ENST00000597315 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
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BRD4-208ENST00000597315 MDS2Q8NDY4 140 aa25.09■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 SLC2A12Q8TD20 617 aa25.09■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 VPS29Q9UBQ0 182 aa25.09■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 ITGA10O75578 1167 aa25.08■■□□□ 1.61
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BRD4-208ENST00000597315 SSR4P51571 173 aa25.08■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 GPR143P51810 404 aa25.08■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
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BRD4-208ENST00000597315 SLC25A25Q6KCM7 469 aa25.08■■□□□ 1.61
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BRD4-208ENST00000597315 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
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BRD4-208ENST00000597315 HBEGFQ99075 208 aa25.08■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 PARD6BQ9BYG5 372 aa25.08■■□□□ 1.61
BRD4-208ENST00000597315 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
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BRD4-208ENST00000597315 SLC25A12O75746 678 aa25.07■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 ESRRBO95718 433 aa25.07■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 NAGLUP54802 743 aa25.07■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 SLC18A2Q05940 514 aa25.07■■□□□ 1.6
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BRD4-208ENST00000597315 C6orf163Q5TEZ5 329 aa25.07■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 ARMC10Q8N2F6 343 aa25.07■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
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BRD4-208ENST00000597315 TAAR6Q96RI8 345 aa25.07■■□□□ 1.6
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BRD4-208ENST00000597315 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.65e-8■■■□□ 19.2
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BRD4-208ENST00000597315 SP1P08047 785 aa25.06■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 DNAJB13P59910 316 aa25.06■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 ASPHQ12797 758 aa25.06■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa25.06■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 NR4A3Q92570 626 aa25.06■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 APOPT1Q96IL0 206 aa25.06■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 OXSMQ9NWU1 459 aa25.06■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 ERVK-11Q9UQG0 969 aa25.06■■□□□ 1.6
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