RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596351.5

LTBP4-215, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 512 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-215	ENST00000596351	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	ASPH	Q12797	758 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	SLAMF1	Q13291	335 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	SERTAD2	Q14140	314 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	MROH9	Q5TGP6	573 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	RTL4	Q6ZR62	310 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	CHSY3	Q70JA7	882 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	EID3	Q8N140	333 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	UBE2E3	Q969T4	207 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	UCK2	Q9BZX2	261 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	SPACA6	W5XKT8	324 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	HMX2	A2RU54	273 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	EPB42	P16452	691 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	CNR1	P21554	472 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	CRABP2	P29373	138 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	SSTR2	P30874	369 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	PIGA	P37287	484 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	STT3A	P46977	705 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	NUP107	P57740	925 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	SLC7A5	Q01650	507 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	TNFRSF17	Q02223	184 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	FOLH1	Q04609	750 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	TLE4	Q04727	773 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	PFKFB4	Q16877	469 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	GK5	Q6ZS86	529 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	ACBD4	Q8NC06	268 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	OR8K3	Q8NH51	312 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	UCN3	Q969E3	161 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	DGAT2	Q96PD7	388 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	RAB17	Q9H0T7	212 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	SNX15	Q9NRS6	342 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	ACOT9	Q9Y305	439 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	ITPR3	Q14573	2671 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	MED12	Q93074	2177 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	GLOD5	A6NK44	160 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	TMPRSS11D	O60235	418 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	EED	O75530	441 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	ATP6AP2	O75787	350 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	LRAT	O95237	230 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	IGKV3-11	P04433	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	C2	P06681	752 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	GFAP	P14136	432 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	COX7A2	P14406	83 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	SERPINB1	P30740	379 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	CASQ1	P31415	396 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	PIK3CG	P48736	1102 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	GUCY2D	Q02846	1103 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	CAV1	Q03135	178 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	PCDH1	Q08174	1060 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	PMPCA	Q10713	525 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	FOXO1	Q12778	655 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	NAB1	Q13506	487 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	SETDB1	Q15047	1291 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	GXYLT1	Q4G148	440 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	PAOX	Q6QHF9	649 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LTBP4-215	ENST00000596351	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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